More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1813 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  100 
 
 		 332 aa  679    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  99.7 
 
 		 332 aa  678    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  70.52 
 
 		 329 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  66.97 
 
 		 329 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  66.97 
 
 		 329 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  66.97 
 
 		 329 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  61.42 
 
 		 325 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  61.64 
 
 		 309 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  56.71 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  57.45 
 
 		 328 aa  362  5.0000000000000005e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  56.53 
 
 		 328 aa  358  8e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  54.26 
 
 		 318 aa  344  8.999999999999999e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  53.59 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  53.43 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  53.59 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  53.43 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  53.59 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  58.75 
 
 		 422 aa  276  4e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  46.75 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  46.63 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  46.63 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  46.31 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  46.29 
 
 		 330 aa  249  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  44.41 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  44.41 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  44.41 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  43.11 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  42.52 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  42.23 
 
 		 335 aa  233  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  43.03 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  43.03 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  43.03 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  43.03 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  43.16 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  43.03 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  42.68 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  42.68 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  41.57 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  41.93 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  41.93 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  41.57 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  41.57 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  41.25 
 
 		 351 aa  215  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  41.25 
 
 		 351 aa  215  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  42.12 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  40.18 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  42.11 
 
 		 316 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  42.11 
 
 		 316 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  40.81 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  41.93 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  41.93 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  41.93 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  40.72 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  41.07 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  41.07 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  41.61 
 
 		 316 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  40.96 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  40.06 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  40.61 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  37.61 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  45 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5727  histidine kinase  71.05 
 
 		 151 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.21896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5281  histidine kinase  71.05 
 
 		 151 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.263883  normal  0.386303 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  37.38 
 
 		 195 aa  115  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  30.62 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.29 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.29 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.29 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.29 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.29 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  30.29 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  29.17 
 
 		 597 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  28.74 
 
 		 380 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  32.14 
 
 		 383 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  28.9 
 
 		 400 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0490  transposase  48.35 
 
 		 99 aa  85.9  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  29.58 
 
 		 323 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  29.87 
 
 		 369 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  29.87 
 
 		 377 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  29.87 
 
 		 377 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  29.87 
 
 		 377 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  29.87 
 
 		 377 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>