183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5614 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5614  putative transposase  100 
 
 		 208 aa  420  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  44.79 
 
 		 313 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  44.79 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  44.23 
 
 		 314 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  44.23 
 
 		 314 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  44.23 
 
 		 314 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  44.23 
 
 		 314 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  44.23 
 
 		 314 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  43.84 
 
 		 318 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  43.84 
 
 		 318 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  43.84 
 
 		 318 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  47.1 
 
 		 316 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  47.1 
 
 		 316 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  47.1 
 
 		 316 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  47.1 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  47.1 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  37.65 
 
 		 341 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  37.65 
 
 		 333 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  37.65 
 
 		 333 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  37.65 
 
 		 341 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  37.65 
 
 		 333 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  37.65 
 
 		 333 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  37.06 
 
 		 321 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  37.06 
 
 		 333 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  45.16 
 
 		 316 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  40.52 
 
 		 347 aa  94  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  40.52 
 
 		 330 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  39.87 
 
 		 330 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  39.87 
 
 		 330 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  39.87 
 
 		 330 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  39.02 
 
 		 315 aa  89.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  32.57 
 
 		 358 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  32.57 
 
 		 358 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  32.57 
 
 		 358 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  32.57 
 
 		 358 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  32.57 
 
 		 358 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  39.33 
 
 		 309 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  39.33 
 
 		 325 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  41.67 
 
 		 481 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  37.13 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  37.67 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  37.67 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  37.67 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  39.31 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  39.31 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  37.91 
 
 		 351 aa  72.4  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  37.91 
 
 		 351 aa  72.4  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0395  hypothetical protein  32.19 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  37.76 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  31.63 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  37.91 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  37.91 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  37.25 
 
 		 335 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  30.59 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  34.97 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  36.57 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  31.16 
 
 		 335 aa  65.1  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  35.67 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  40.17 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  35.95 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  34.07 
 
 		 597 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  35.29 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  30.34 
 
 		 379 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  30.34 
 
 		 379 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  30.34 
 
 		 379 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  30.34 
 
 		 379 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  30.34 
 
 		 379 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  31.69 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0529  Integrase catalytic region  30.28 
 
 		 325 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.247566  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  29.15 
 
 		 320 aa  53.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2451  integrase catalytic subunit  34.51 
 
 		 326 aa  51.6  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.908146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0538  Integrase catalytic region  29.58 
 
 		 325 aa  51.6  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1950  Integrase catalytic region  29.58 
 
 		 325 aa  51.6  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 324 aa  51.6  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 324 aa  51.6  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 324 aa  51.6  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 324 aa  51.6  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4624  helix-turn-helix, fis-type  34.62 
 
 		 156 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.318976  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0872  helix-turn-helix, Fis-type  31.86 
 
 		 326 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1945  helix-turn-helix, Fis-type  31.86 
 
 		 326 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1964  helix-turn-helix, Fis-type  31.86 
 
 		 326 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>