More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3273 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  97.9 
 
 
335 aa  665    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  96.42 
 
 
335 aa  663    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  92.81 
 
 
351 aa  643    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  92.81 
 
 
351 aa  643    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  100 
 
 
335 aa  680    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  99.4 
 
 
335 aa  679    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  63.33 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  62.43 
 
 
335 aa  396  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  62.69 
 
 
335 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  61.83 
 
 
335 aa  393  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  63.23 
 
 
320 aa  373  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  59.81 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  50.88 
 
 
330 aa  298  9e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  50.88 
 
 
330 aa  295  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  50.88 
 
 
330 aa  295  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  50.74 
 
 
347 aa  296  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  50.59 
 
 
330 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  46.2 
 
 
333 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  46.2 
 
 
333 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  46.2 
 
 
333 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  46.2 
 
 
321 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  46.2 
 
 
333 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  45.9 
 
 
333 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  45.77 
 
 
341 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  45.77 
 
 
341 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 
329 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 
329 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 
329 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  42.22 
 
 
329 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  41.98 
 
 
318 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  41.98 
 
 
318 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  41.98 
 
 
318 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  41.07 
 
 
332 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  41.07 
 
 
332 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  42.6 
 
 
325 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  38.92 
 
 
328 aa  197  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  42.63 
 
 
309 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  38.87 
 
 
328 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  39.21 
 
 
481 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  38.91 
 
 
318 aa  186  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
358 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
358 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  35 
 
 
314 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  35 
 
 
314 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  35 
 
 
314 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  35.12 
 
 
314 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  36.76 
 
 
315 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  35.12 
 
 
314 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  36.87 
 
 
315 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  36.87 
 
 
315 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  35.44 
 
 
315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  34.81 
 
 
316 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  34.82 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  34.82 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  34.81 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  34.82 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  40.98 
 
 
422 aa  160  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  35.42 
 
 
313 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  34.82 
 
 
316 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  35.41 
 
 
195 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5281  histidine kinase  44.66 
 
 
151 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.263883  normal  0.386303 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5727  histidine kinase  44.66 
 
 
151 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.21896  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  28.66 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5102  integrase catalytic subunit  27.48 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  27.8 
 
 
597 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  29.51 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  29.18 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  27.17 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  29.18 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4857  integrase catalytic subunit  27.48 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3309  integrase catalytic subunit  27.48 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5758  integrase catalytic subunit  27.48 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0647167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  27.17 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  28.05 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.05 
 
 
381 aa  75.9  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  28.05 
 
 
381 aa  75.9  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.05 
 
 
381 aa  75.9  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.05 
 
 
381 aa  75.9  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1950  Integrase catalytic region  26.26 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.05 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.05 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>