265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1300 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0576  radical SAM domain-containing protein  91.25 
 
 
457 aa  853    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.11056  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1371  radical SAM domain-containing protein  92.56 
 
 
457 aa  857    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145601 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1363  radical SAM domain-containing protein  71.4 
 
 
458 aa  667    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.359943  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1300  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
457 aa  931    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.32123  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0312  radical SAM domain-containing protein  63.41 
 
 
446 aa  543  1e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.977529  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  39.53 
 
 
332 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0658  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 
336 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  32.4 
 
 
345 aa  199  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158683 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1926  radical SAM domain-containing protein  31.39 
 
 
347 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.265306  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0739  radical SAM domain-containing protein  32.59 
 
 
347 aa  189  9e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0458  radical SAM domain-containing protein  32.29 
 
 
359 aa  172  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.14 
 
 
335 aa  60.5  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 
578 aa  57.4  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1101  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.46 
 
 
310 aa  57.4  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.22 
 
 
317 aa  57.4  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  23.43 
 
 
459 aa  57  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  22.09 
 
 
608 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  25.71 
 
 
370 aa  57  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 
573 aa  57  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 
512 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.57 
 
 
379 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.37 
 
 
319 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 
573 aa  56.2  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.86 
 
 
376 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.41 
 
 
327 aa  55.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1031  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.75 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0405  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.5 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.03 
 
 
356 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.75 
 
 
342 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.3 
 
 
356 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.75 
 
 
342 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.4 
 
 
325 aa  54.3  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0195901 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0024  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.78 
 
 
309 aa  53.9  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  26.53 
 
 
331 aa  53.5  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1969  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.71 
 
 
384 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.046264  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.28 
 
 
376 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  25 
 
 
445 aa  53.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.06 
 
 
317 aa  53.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.14 
 
 
372 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0454  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.86 
 
 
368 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.3 
 
 
308 aa  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.77 
 
 
333 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1242  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.65 
 
 
353 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00350809  normal  0.534968 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  23.37 
 
 
506 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.29 
 
 
397 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2160  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.32 
 
 
322 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 
441 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.67 
 
 
375 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.01 
 
 
297 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4827  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.28 
 
 
382 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  23.26 
 
 
465 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.47 
 
 
372 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.150744  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.51 
 
 
345 aa  51.6  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.44 
 
 
299 aa  51.2  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  23.24 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0689  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.86 
 
 
389 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.62446  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2175  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  25.73 
 
 
350 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4556  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.11 
 
 
337 aa  50.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 
287 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.76 
 
 
298 aa  50.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2098  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.84 
 
 
400 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456256  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 
471 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.86 
 
 
373 aa  50.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4823  coproporphyrinogen III oxidase  28.69 
 
 
456 aa  50.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  28.87 
 
 
369 aa  50.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2492  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.84 
 
 
400 aa  50.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250234  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.43 
 
 
380 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.12 
 
 
326 aa  50.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.81 
 
 
337 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.81 
 
 
337 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.69 
 
 
330 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3584  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.14 
 
 
338 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  24.86 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4622  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, N-terminus  33.33 
 
 
252 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4457  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.39 
 
 
339 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.58 
 
 
298 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.03 
 
 
337 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41640  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.14 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  23.71 
 
 
569 aa  49.7  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.49 
 
 
323 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.49 
 
 
323 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.91 
 
 
351 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.15 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 
359 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1202  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.8 
 
 
335 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 
579 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50634  predicted protein  26.87 
 
 
336 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.612985 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4843  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.34 
 
 
337 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 
471 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.53 
 
 
335 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.886465  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4475  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.39 
 
 
337 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.88 
 
 
344 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 
342 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 
467 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.92 
 
 
329 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2470  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.26 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.616066 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.39 
 
 
337 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.979257  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.55 
 
 
319 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>