More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0658 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0658  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
336 aa  676    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  48.14 
 
 
332 aa  311  1e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1926  radical SAM domain-containing protein  43.06 
 
 
347 aa  264  1e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.265306  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  43.02 
 
 
345 aa  260  2e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158683 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0739  radical SAM domain-containing protein  42.57 
 
 
347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0458  radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 
359 aa  247  2e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1363  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 
458 aa  239  4e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.359943  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0576  radical SAM domain-containing protein  35.92 
 
 
457 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.11056  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1371  radical SAM domain-containing protein  34.77 
 
 
457 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145601 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1300  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 
457 aa  225  9e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.32123  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0312  radical SAM domain-containing protein  33.62 
 
 
446 aa  209  5e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.977529  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.82 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.32 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.32 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.97 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.82 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.67 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.32 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.58 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0726639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1558  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.12 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.37 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0176  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.28 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1387  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.44 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0197  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.37 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.28 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.56 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.03 
 
 
344 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.83 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.69 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.69 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 
384 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.81 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  32.79 
 
 
340 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.81 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.93 
 
 
337 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.82 
 
 
350 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 
359 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.89 
 
 
345 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.49 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.62 
 
 
348 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.02 
 
 
349 aa  62.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0274  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.93 
 
 
337 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.481355  hitchhiker  0.000000283417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4793  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.49 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113371  hitchhiker  0.00000239799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.59 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.33 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4402  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.49 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320325  hitchhiker  0.00467523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4452  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.37 
 
 
326 aa  60.5  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0087  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.41 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0823878  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0285  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.49 
 
 
337 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.85 
 
 
351 aa  60.1  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 
327 aa  60.5  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.93 
 
 
337 aa  59.7  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.62159  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.05 
 
 
333 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.07 
 
 
346 aa  59.7  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1498  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.88 
 
 
326 aa  59.3  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286832  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  28.51 
 
 
441 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.68 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.7 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.81 
 
 
348 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3524  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.55 
 
 
340 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.43 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.42 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.32 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 
338 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0284  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.93 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0281  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.93 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.67 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420701  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.77 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.823795  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.44 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.93 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.87 
 
 
339 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  30.16 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.04 
 
 
325 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0881  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.62 
 
 
329 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659843  hitchhiker  0.00030609 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 
377 aa  56.6  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  28.86 
 
 
341 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.23 
 
 
341 aa  56.2  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.69 
 
 
332 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.78 
 
 
321 aa  56.2  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1915  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.24 
 
 
321 aa  56.2  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4099  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.73 
 
 
328 aa  56.2  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.43 
 
 
344 aa  56.2  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  21.84 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  34.55 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.14 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.93 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.97 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50634  predicted protein  25.75 
 
 
336 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.612985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1061  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.67 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 
471 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.81 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2923  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.22 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.545573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.97 
 
 
326 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2295  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.41 
 
 
329 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>