More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0458 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0458  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  709    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1926  radical SAM domain-containing protein  74.78 
 
 		 347 aa  521  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.265306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0739  radical SAM domain-containing protein  68.51 
 
 		 347 aa  503  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  70.14 
 
 		 345 aa  498  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.158683 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0658  radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  40.77 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0576  radical SAM domain-containing protein  32.19 
 
 		 457 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.11056  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1371  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145601 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1363  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 458 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.359943  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1300  radical SAM domain-containing protein  32.29 
 
 		 457 aa  182  7e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.32123  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0312  radical SAM domain-containing protein  30.85 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.977529  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.28 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.73 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.79 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.708354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.21 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.75 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4793  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.24 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113371  hitchhiker  0.00000239799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.32 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2160  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.31 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.64 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0355  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.14 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2799  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.58 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.72 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.36 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.68 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1498  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.91 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286832  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.94 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.86 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4402  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.25 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320325  hitchhiker  0.00467523 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.16 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2295  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.16 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 608 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4622  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, N-terminus  26.7 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.979257  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.52 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.04 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1832  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.1 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0087  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.62 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0823878  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4457  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.7 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4475  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.7 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.88 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1915  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.82 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.7 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4843  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.7 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.11 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.11 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.23 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0399  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.7 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.43 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  26.86 
 
 		 265 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.03 
 
 		 344 aa  55.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1426  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  28.11 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.51 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4556  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.7 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0176  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.87 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.27 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0274  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.62 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.481355  hitchhiker  0.000000283417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3524  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.48 
 
 		 340 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.09 
 
 		 331 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 287 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.14 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.84 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.62159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0281  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.12 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.12 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0284  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.12 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.95 
 
 		 338 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.11 
 
 		 317 aa  54.3  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4452  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.62 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0285  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.36 
 
 		 337 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.72 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4867  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.42 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 		 324 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0197  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.73 
 
 		 320 aa  53.1  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.46 
 
 		 320 aa  53.1  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  25.59 
 
 		 327 aa  53.1  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.52 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.39 
 
 		 328 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.68 
 
 		 356 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.37 
 
 		 344 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.57 
 
 		 337 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1351  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.9 
 
 		 340 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.98 
 
 		 337 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0187  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.56 
 
 		 330 aa  52.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00819239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0133  nitrogen fixation protein  27.03 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.17 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.89 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.26 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.42 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.26 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.33 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.136733 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 489 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>