More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1225 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1225  histidine kinase  100 
 
 		 423 aa  830    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1411  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95.02 
 
 		 698 aa  795    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.05 
 
 		 732 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 		 731 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.395516  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.57 
 
 		 731 aa  176  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.723997  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.7 
 
 		 730 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.292082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1096  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.27 
 
 		 730 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0842  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.38 
 
 		 732 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.97 
 
 		 731 aa  160  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00776306  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.25 
 
 		 729 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54969  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.22 
 
 		 731 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.41 
 
 		 729 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000025801 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.35 
 
 		 732 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1594  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 543 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.489984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1764  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 729 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0298102 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0389  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.09 
 
 		 729 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 614 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 		 613 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 		 614 aa  99.8  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0444  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 613 aa  96.7  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0364501  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 		 639 aa  92.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 		 639 aa  90.5  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 639 aa  86.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 		 640 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 		 620 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 		 641 aa  80.1  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.58 
 
 		 815 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.3 
 
 		 879 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 792 aa  67.4  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  32.71 
 
 		 822 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 		 730 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0055  sensor protein  35.87 
 
 		 717 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.782355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3073  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.89 
 
 		 677 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  39.51 
 
 		 713 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 		 754 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 621 aa  57.8  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1240  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.41 
 
 		 777 aa  57.4  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  21.83 
 
 		 674 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  18.78 
 
 		 628 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2721  putative sensor with HAMP domain protein  43.4 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  33.72 
 
 		 730 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  28.72 
 
 		 762 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  39.19 
 
 		 708 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  33.7 
 
 		 817 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 755 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  22.4 
 
 		 1133 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 471 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.47 
 
 		 669 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.73 
 
 		 621 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.01 
 
 		 604 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  43.64 
 
 		 698 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01278  Putative signal protein with HAMP, GGDEF and EAL domains  33.33 
 
 		 785 aa  54.3  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0804794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.17 
 
 		 758 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  30.59 
 
 		 1119 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 682 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3738  histidine kinase  29.59 
 
 		 601 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 710 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 594 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0991  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 549 aa  53.5  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000699146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  35.06 
 
 		 591 aa  53.5  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.77 
 
 		 1058 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1937  GGDEF domain/HAMP domain-containing protein  31.51 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  24.49 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 633 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.9 
 
 		 695 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 680 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.02 
 
 		 611 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.31 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 463 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  23.81 
 
 		 613 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 671 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1349  sensor protein  27.17 
 
 		 574 aa  52.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0628361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  23.81 
 
 		 613 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1989  diguanylate cyclase  28.38 
 
 		 442 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000357818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.96 
 
 		 623 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2144  sensor histidine kinase  27.44 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  29.13 
 
 		 576 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 873 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00758089  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.44 
 
 		 545 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 528 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.53 
 
 		 835 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.02 
 
 		 608 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  22.02 
 
 		 608 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  39.71 
 
 		 687 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2819  diguanylate cyclase  32.43 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000520374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  24.57 
 
 		 482 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2387  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.68 
 
 		 604 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 785 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0214  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.78 
 
 		 816 aa  50.8  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0946  sensory box/GGDEF family protein  32.22 
 
 		 842 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  27.78 
 
 		 660 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  27.78 
 
 		 660 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  27.78 
 
 		 660 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  27.78 
 
 		 660 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  27.78 
 
 		 660 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.28 
 
 		 512 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000106495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>