More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1218 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1218  CBS domain-containing protein  100 
 
 
321 aa  634    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1418  CBS domain-containing protein  95.33 
 
 
321 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0490  CBS domain-containing protein  95.95 
 
 
321 aa  579  1e-164  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1407  signal transduction protein  69.88 
 
 
322 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1203  signal transduction protein  53.25 
 
 
315 aa  332  5e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.803351  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.88 
 
 
769 aa  79.3  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.72 
 
 
877 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  35.67 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  38.1 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  36.92 
 
 
593 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  28.93 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  28.97 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  29.41 
 
 
867 aa  67.4  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.77 
 
 
873 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.48 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  28.04 
 
 
890 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  29.61 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 
262 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
873 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  36.92 
 
 
590 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  28.57 
 
 
577 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  33.33 
 
 
338 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  35.38 
 
 
370 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  29.61 
 
 
158 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  30.23 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 
863 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  28.69 
 
 
880 aa  63.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 
384 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  30 
 
 
232 aa  62.8  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  35.2 
 
 
166 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  35.34 
 
 
865 aa  62.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  32.84 
 
 
863 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 
336 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  32.48 
 
 
909 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  27.87 
 
 
148 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1082  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.61 
 
 
514 aa  61.6  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.62 
 
 
482 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0687  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.83 
 
 
501 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.559264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3055  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.51 
 
 
505 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171926 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 
378 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.46 
 
 
486 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0948  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.74 
 
 
486 aa  60.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  37.82 
 
 
883 aa  60.8  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  33.81 
 
 
845 aa  60.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  28.98 
 
 
411 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  30.08 
 
 
394 aa  60.1  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1696  CBS domain-containing protein  29.08 
 
 
163 aa  60.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000358324  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  35.2 
 
 
146 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  29.66 
 
 
149 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  27.05 
 
 
147 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1899  IMP dehydrogenase/GMP reductase  33.61 
 
 
517 aa  60.1  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  35.2 
 
 
146 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  35.2 
 
 
146 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30 
 
 
504 aa  59.7  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.37 
 
 
513 aa  59.3  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398253  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.08 
 
 
488 aa  59.3  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.31 
 
 
141 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.41 
 
 
489 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28670  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.34 
 
 
507 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.82 
 
 
488 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  30.47 
 
 
907 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 
261 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  29.03 
 
 
221 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.34 
 
 
491 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08690  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.99 
 
 
499 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0432795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.88 
 
 
483 aa  58.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  28.17 
 
 
247 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  33.85 
 
 
219 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  28.57 
 
 
145 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  30 
 
 
373 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  29.94 
 
 
393 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  29.45 
 
 
412 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.73 
 
 
903 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0521  diguanylate cyclase  33.9 
 
 
290 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164906  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  29.61 
 
 
155 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  32.56 
 
 
342 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  29.93 
 
 
877 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.28 
 
 
483 aa  57.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  29.33 
 
 
155 aa  57  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1299  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
264 aa  57  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.04 
 
 
485 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.52 
 
 
482 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  36.97 
 
 
859 aa  56.6  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 
885 aa  56.6  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  30.38 
 
 
343 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.52 
 
 
482 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  28.57 
 
 
370 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  26.95 
 
 
907 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 
225 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.37 
 
 
903 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  32.06 
 
 
219 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  33.59 
 
 
295 aa  56.2  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  28.21 
 
 
432 aa  56.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0437  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.04 
 
 
488 aa  56.2  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0448  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.04 
 
 
488 aa  56.2  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2585  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.55 
 
 
507 aa  55.8  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.23 
 
 
483 aa  55.8  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3645  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.61 
 
 
500 aa  55.8  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  29.17 
 
 
904 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 
216 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>