More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_19480 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_19480  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  100 
 
 
233 aa  441  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.544408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0748  ABC transporter related  60.77 
 
 
333 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31190  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  56.16 
 
 
348 aa  207  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264527  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0180  ABC transporter related protein  59.56 
 
 
352 aa  202  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3746  ABC transporter related  52.6 
 
 
346 aa  201  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3807  ABC transporter related  59.13 
 
 
354 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0435  ABC transporter related  56.73 
 
 
332 aa  198  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0316  ABC transporter related  50.24 
 
 
342 aa  194  8.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.000000000465057  decreased coverage  0.0034539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.87 
 
 
370 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  52.58 
 
 
388 aa  192  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4466  ABC transporter-like  47.6 
 
 
351 aa  191  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  48.86 
 
 
366 aa  191  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.48 
 
 
386 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.48 
 
 
386 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  50.73 
 
 
386 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  48.86 
 
 
328 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  50 
 
 
343 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.04 
 
 
345 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.74 
 
 
352 aa  188  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  45.67 
 
 
386 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.63 
 
 
390 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.15 
 
 
386 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
386 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  49.54 
 
 
348 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  53.77 
 
 
354 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 
366 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.15 
 
 
386 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  49.53 
 
 
347 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  50 
 
 
353 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  55.19 
 
 
346 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4355  ABC transporter related  48.8 
 
 
342 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  55.19 
 
 
346 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  55.19 
 
 
346 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  50 
 
 
353 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  48.77 
 
 
352 aa  185  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
384 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  44.44 
 
 
384 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
384 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  44.14 
 
 
355 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.56 
 
 
384 aa  184  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1949  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
384 aa  184  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.415824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.86 
 
 
384 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.97 
 
 
377 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50.48 
 
 
363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 
353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 
377 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1343  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.26 
 
 
378 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  48.4 
 
 
368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.4 
 
 
352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  46.92 
 
 
377 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 
377 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.78 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 
377 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  44.89 
 
 
366 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.4 
 
 
355 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 
355 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4663  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.06 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  49.49 
 
 
329 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 
371 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  48.96 
 
 
388 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0939  ABC putrescine transporter, ATPase subunit PotG  44.71 
 
 
387 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301968  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  49.49 
 
 
357 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  49.06 
 
 
356 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.97 
 
 
377 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.39 
 
 
384 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.39 
 
 
384 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4324  ABC transporter related  49.52 
 
 
368 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0269619  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  51.72 
 
 
344 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.39 
 
 
384 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1344  ABC transporter related  47 
 
 
227 aa  182  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.274567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
354 aa  182  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  45.83 
 
 
378 aa  182  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  49.76 
 
 
330 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 
356 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 
375 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  48.33 
 
 
356 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 
400 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.21 
 
 
377 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  49.32 
 
 
358 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2813  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.84 
 
 
384 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  51.92 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  49.32 
 
 
358 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  57.22 
 
 
363 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  48.98 
 
 
357 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04180  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  57.21 
 
 
379 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.40669  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  51.92 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  50.94 
 
 
379 aa  181  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  49.23 
 
 
353 aa  181  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  52.4 
 
 
257 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  46.67 
 
 
349 aa  181  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.67 
 
 
387 aa  181  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7682  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.84 
 
 
379 aa  181  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3686 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  46.45 
 
 
377 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.45 
 
 
377 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.54 
 
 
388 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  46.45 
 
 
377 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  46.45 
 
 
377 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  46.45 
 
 
377 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  46.45 
 
 
377 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2991  ABC transporter related protein  47 
 
 
224 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>