212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2944 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2944  glycerate kinase  100 
 
 
364 aa  689    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3569  glycerate kinase  80.86 
 
 
353 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.581424  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12233  hypothetical protein  67.43 
 
 
381 aa  368  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.194951  normal  0.855541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3065  glycerate kinase  64.76 
 
 
359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.831478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1529  glycerate kinase  55.75 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107717  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0956  glycerate kinase  47.97 
 
 
373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.421654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1660  glycerate kinase  46.53 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.162616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1010  glycerate kinase  49.18 
 
 
363 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0123  glycerate kinase  44.24 
 
 
374 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  38.68 
 
 
378 aa  199  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  38.68 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  38.68 
 
 
378 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  42.97 
 
 
379 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4147  glycerate kinase  44.24 
 
 
372 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.676652  decreased coverage  0.00778507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0239  Glycerate kinase  43.97 
 
 
374 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  41.95 
 
 
379 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  40.53 
 
 
382 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  38.36 
 
 
377 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  42.29 
 
 
379 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  41.95 
 
 
380 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3537  glycerate kinase  43.08 
 
 
386 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181581  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  43.62 
 
 
381 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3130  glycerate kinase  41.29 
 
 
377 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00415476  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  38.93 
 
 
389 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  40.96 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  42.05 
 
 
381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  39.51 
 
 
383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  40.9 
 
 
378 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  40.96 
 
 
379 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  33.59 
 
 
380 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  37.8 
 
 
381 aa  176  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  41.22 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  35.62 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12960  glycerate kinase  42.66 
 
 
375 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  42.48 
 
 
381 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  39.02 
 
 
378 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  39.44 
 
 
380 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  36.83 
 
 
381 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  35.64 
 
 
379 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  35.64 
 
 
379 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  35.56 
 
 
381 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  35.64 
 
 
379 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  35.64 
 
 
379 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  36 
 
 
381 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  36.83 
 
 
381 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  36.53 
 
 
408 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  36.53 
 
 
408 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  36.83 
 
 
379 aa  169  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  35.98 
 
 
384 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  36.56 
 
 
381 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  35.9 
 
 
385 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  36.56 
 
 
381 aa  169  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  36.56 
 
 
381 aa  169  9e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  41.69 
 
 
375 aa  169  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  36.56 
 
 
381 aa  169  9e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  41.76 
 
 
381 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  38.46 
 
 
384 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  35.04 
 
 
394 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  35.47 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  35.9 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  35.64 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  35.9 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1372  glycerate kinase  37.46 
 
 
397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0125606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  37.01 
 
 
381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  34.62 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  36.02 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  37.81 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  35.98 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3305  glycerate kinase  42.86 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  35.37 
 
 
387 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  35.14 
 
 
373 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  35.47 
 
 
381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  36.81 
 
 
373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  33.24 
 
 
384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  36.84 
 
 
384 aa  163  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  37.67 
 
 
380 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2549  glycerate kinase  38.54 
 
 
385 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  36.17 
 
 
381 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  33.87 
 
 
379 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  37.3 
 
 
380 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3147  glycerate kinase  43.13 
 
 
357 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  36.51 
 
 
383 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  36.58 
 
 
388 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  36.24 
 
 
380 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5723  glycerate kinase  41.46 
 
 
397 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  37.04 
 
 
380 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4561  glycerate kinase  39.84 
 
 
387 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.532738 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  33.52 
 
 
386 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  42.2 
 
 
397 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  33.87 
 
 
380 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  35.98 
 
 
380 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  36.02 
 
 
378 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  35.98 
 
 
380 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  35.98 
 
 
380 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1024  glycerate kinase  38.91 
 
 
378 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14280  glycerate kinase  37.8 
 
 
396 aa  156  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000570843  normal  0.0813973 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1342  glycerate kinase  38.3 
 
 
378 aa  156  7e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  34.49 
 
 
380 aa  156  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  37.91 
 
 
381 aa  155  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4863  glycerate kinase GcxK  34.22 
 
 
380 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432659  normal  0.859759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>