215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1529 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1529  glycerate kinase  100 
 
 		 366 aa  689    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3065  glycerate kinase  57.88 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.831478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3569  glycerate kinase  56.9 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.581424  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2944  glycerate kinase  55.08 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12233  hypothetical protein  53.18 
 
 		 381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.194951  normal  0.855541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1010  glycerate kinase  50 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0956  glycerate kinase  47.54 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.421654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4147  glycerate kinase  43.47 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.676652  decreased coverage  0.00778507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  40.97 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  37.8 
 
 		 381 aa  192  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  38.71 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  39.07 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  38.71 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  39.07 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3537  glycerate kinase  44.47 
 
 		 386 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181581  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  39.07 
 
 		 381 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  37.93 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  39.07 
 
 		 381 aa  189  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  39.07 
 
 		 381 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  39.07 
 
 		 381 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  38.52 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  39.17 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  40.27 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  38.46 
 
 		 384 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1163  glycerate kinase  44.54 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3305  glycerate kinase  42.54 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  37.57 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  40.43 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  36.07 
 
 		 378 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  36.07 
 
 		 378 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1660  glycerate kinase  42.49 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.162616 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  36.6 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  35.81 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  37.4 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  40.96 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  37.14 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  37.74 
 
 		 380 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  37.14 
 
 		 380 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  37.14 
 
 		 380 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  37.14 
 
 		 380 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  35.42 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  35.85 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  40.32 
 
 		 388 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  40.32 
 
 		 388 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  40.59 
 
 		 381 aa  173  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3147  glycerate kinase  46.83 
 
 		 357 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  36.39 
 
 		 379 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  36.39 
 
 		 379 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  40.05 
 
 		 388 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  36.39 
 
 		 379 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  36.39 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  36.12 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3130  glycerate kinase  41.19 
 
 		 377 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00415476  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  36.99 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  36.99 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  36.99 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  39.89 
 
 		 379 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  41.02 
 
 		 379 aa  169  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  36.99 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  35.54 
 
 		 379 aa  169  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  38.5 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  40.81 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  40.99 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  37.47 
 
 		 395 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  31.72 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  39.08 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  36.42 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0440  Glycerate kinase  41.1 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  39.73 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3692  glycerate kinase  37.57 
 
 		 409 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4863  glycerate kinase GcxK  35.71 
 
 		 380 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432659  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20350  glycerate kinase  42.54 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  32.88 
 
 		 379 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  35.01 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  32.66 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  36.13 
 
 		 381 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  35.84 
 
 		 381 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  36.13 
 
 		 381 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  36.13 
 
 		 381 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  38.54 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  36.13 
 
 		 381 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  36.13 
 
 		 381 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  33.42 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  33.06 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  35.81 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2233  glycerate kinase  35.38 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  35.84 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  38.27 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  30.73 
 
 		 381 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  42.64 
 
 		 381 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  35.71 
 
 		 384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  34.86 
 
 		 380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  42.25 
 
 		 381 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  35.28 
 
 		 384 aa  156  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  32.43 
 
 		 383 aa  155  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2001  glycerate kinase  43.36 
 
 		 369 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2047  glycerate kinase  43.36 
 
 		 369 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  39.78 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3439  Glycerate kinase  37.05 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  31.55 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>