216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3099 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  99.21 
 
 		 381 aa  750    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  100 
 
 		 381 aa  756    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  98.16 
 
 		 381 aa  743    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  98.43 
 
 		 381 aa  744    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  97.38 
 
 		 381 aa  704    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  99.21 
 
 		 381 aa  750    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  98.43 
 
 		 381 aa  744    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  98.95 
 
 		 381 aa  749    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  80.74 
 
 		 382 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  80.74 
 
 		 382 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  80.74 
 
 		 382 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  80.74 
 
 		 382 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  58.38 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  60.48 
 
 		 378 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  60.21 
 
 		 378 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  60.48 
 
 		 378 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  57.89 
 
 		 380 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  58.84 
 
 		 380 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  56.99 
 
 		 387 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  57.63 
 
 		 380 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  58.84 
 
 		 380 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  57.37 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  57.22 
 
 		 381 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  57.37 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  57.11 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  58.84 
 
 		 388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  61.87 
 
 		 381 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  57.29 
 
 		 384 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  58.58 
 
 		 379 aa  401  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  57.33 
 
 		 384 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  57.18 
 
 		 382 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  56.38 
 
 		 381 aa  391  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  56.12 
 
 		 381 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  56.38 
 
 		 381 aa  391  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  56.38 
 
 		 381 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  56.38 
 
 		 381 aa  391  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  56.38 
 
 		 381 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  56.38 
 
 		 408 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  56.38 
 
 		 408 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  56.32 
 
 		 381 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  54.13 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  55.59 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  55.59 
 
 		 381 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  55.24 
 
 		 394 aa  388  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  53.87 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  55.67 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  55.21 
 
 		 389 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  55.79 
 
 		 381 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  53.87 
 
 		 381 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  53.33 
 
 		 385 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  53.6 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  56.84 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  56.14 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  52.37 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  59.42 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  54.59 
 
 		 377 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  53.6 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  55.41 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  53.87 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  56.06 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  53.6 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  51.99 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  52.12 
 
 		 402 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  51.95 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  54.91 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  54.64 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  52.7 
 
 		 380 aa  371  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  54.91 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  54.91 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  55.44 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  53.46 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0185  glycerate kinase  53.33 
 
 		 381 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  51.47 
 
 		 381 aa  363  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1570  glycerate kinase  52.12 
 
 		 403 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.769204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  54.11 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  54.79 
 
 		 388 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  54.79 
 
 		 388 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  54.79 
 
 		 388 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  53.46 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  52.76 
 
 		 381 aa  360  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  50.8 
 
 		 373 aa  358  6e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  50.8 
 
 		 373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  51.87 
 
 		 380 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  51.99 
 
 		 381 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  55.73 
 
 		 379 aa  345  5e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  49.19 
 
 		 386 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  49.6 
 
 		 381 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  47.73 
 
 		 378 aa  333  4e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  47.06 
 
 		 384 aa  333  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  46.68 
 
 		 381 aa  330  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  49.87 
 
 		 383 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  53.58 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  45.07 
 
 		 383 aa  325  6e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  52.12 
 
 		 378 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4863  glycerate kinase GcxK  47.58 
 
 		 380 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432659  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  53.76 
 
 		 381 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  46.93 
 
 		 380 aa  322  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  46.93 
 
 		 380 aa  322  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  49.33 
 
 		 379 aa  322  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0154  glycerate kinase C-terminus  52.78 
 
 		 341 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.763631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>