215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2233 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2233  glycerate kinase  100 
 
 		 384 aa  764    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1595  glycerate kinase  51.92 
 
 		 376 aa  326  5e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  42.11 
 
 		 379 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  43.32 
 
 		 378 aa  255  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  43.05 
 
 		 378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  43.05 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  42.67 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  44.04 
 
 		 380 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  44.09 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  47.92 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  43.47 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  45.45 
 
 		 381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  44.09 
 
 		 380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  43.83 
 
 		 380 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  43.83 
 
 		 380 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  43.83 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  42.51 
 
 		 384 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  43.85 
 
 		 378 aa  242  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  41.07 
 
 		 387 aa  243  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  42.42 
 
 		 380 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  40.16 
 
 		 381 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  41.75 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  39.9 
 
 		 385 aa  240  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  45.08 
 
 		 388 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  45.08 
 
 		 388 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  45.08 
 
 		 388 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  40.9 
 
 		 382 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  40.16 
 
 		 381 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  39.9 
 
 		 385 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  42.06 
 
 		 380 aa  239  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  40.58 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  43.15 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  45.19 
 
 		 380 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  45.76 
 
 		 408 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  45.76 
 
 		 408 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  48.73 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  39.9 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  40.64 
 
 		 379 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  40.64 
 
 		 379 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  38.16 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  40.64 
 
 		 379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  45.73 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  46.04 
 
 		 381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  45.73 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  45.73 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  42.39 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  45.73 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  45.73 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  40.64 
 
 		 379 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  40.31 
 
 		 378 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  39.79 
 
 		 381 aa  232  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  42.06 
 
 		 379 aa  232  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  37.67 
 
 		 380 aa  232  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  42.22 
 
 		 380 aa  232  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  42.82 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  42.94 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  44.26 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1135  glycerate kinase  36.44 
 
 		 374 aa  229  4e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1926  glycerate kinase  39.57 
 
 		 371 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  38.85 
 
 		 379 aa  229  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  44.82 
 
 		 381 aa  229  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  43.2 
 
 		 381 aa  229  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  37.53 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2292  glycerate kinase  44.48 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  41.21 
 
 		 379 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  43.73 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  39.21 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  42.77 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  43.38 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  35.19 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  43.12 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3045  glycerate kinase  39.94 
 
 		 377 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0181471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  40.68 
 
 		 381 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  39.22 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4561  glycerate kinase  40.46 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.532738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  39.95 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  41.21 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  41.21 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1372  glycerate kinase  41.69 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125606 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  44.44 
 
 		 385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  41.9 
 
 		 382 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  41.9 
 
 		 382 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  35.26 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  42.77 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  42.77 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  42.77 
 
 		 381 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  37.07 
 
 		 373 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  41.52 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  42.77 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  42.77 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  42.77 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  37.07 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  41.98 
 
 		 375 aa  216  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2549  glycerate kinase  40.96 
 
 		 385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24350  glycerate kinase  38.73 
 
 		 376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  41.59 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  41.59 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  34.83 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  41.54 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  39.21 
 
 		 380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>