217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06863 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  100 
 
 		 377 aa  755    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  84.53 
 
 		 378 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  72.68 
 
 		 377 aa  527  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  60.74 
 
 		 378 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  60.48 
 
 		 378 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  60.21 
 
 		 378 aa  430  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  59.63 
 
 		 382 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  61.2 
 
 		 384 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  57.22 
 
 		 381 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  56.8 
 
 		 379 aa  398  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  58.93 
 
 		 384 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  55.82 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  57.29 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  57.29 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  60.45 
 
 		 380 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  57.29 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  57.03 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  56.32 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  55.2 
 
 		 380 aa  385  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  57.84 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  54.93 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  54.93 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  56.08 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  55.68 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  55.68 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  54.67 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  52.31 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  55.68 
 
 		 381 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  55.68 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  54.67 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  54.45 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  55.68 
 
 		 381 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  55.41 
 
 		 381 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  55.68 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  54.67 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  52.86 
 
 		 389 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  55.26 
 
 		 381 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  55.68 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  54.32 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  54.91 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  54.59 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  53.74 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  56.08 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  53.49 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  54.32 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  54.05 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  55.38 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  53.87 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  54.05 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  53.32 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  53.74 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  53 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  51.88 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  52.13 
 
 		 402 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  52.14 
 
 		 384 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  54.13 
 
 		 381 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  52.8 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  56.95 
 
 		 381 aa  360  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1570  glycerate kinase  52.63 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.769204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  53.58 
 
 		 394 aa  359  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  55.41 
 
 		 379 aa  359  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  54.13 
 
 		 380 aa  358  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  53.85 
 
 		 381 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  50.67 
 
 		 381 aa  355  8.999999999999999e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  54.05 
 
 		 388 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  54.05 
 
 		 388 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  54.05 
 
 		 388 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  53.33 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  54.32 
 
 		 381 aa  352  8e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  54.32 
 
 		 408 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  54.32 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  54.32 
 
 		 408 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  53.07 
 
 		 380 aa  351  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  54.32 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  54.32 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  54.05 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  51.2 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  54.05 
 
 		 381 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  52.94 
 
 		 379 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  51.47 
 
 		 381 aa  349  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  53.07 
 
 		 381 aa  348  6e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  50.67 
 
 		 385 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  51.2 
 
 		 395 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  50.67 
 
 		 381 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  49.47 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  55.17 
 
 		 389 aa  347  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  50.4 
 
 		 385 aa  346  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  53.51 
 
 		 381 aa  345  6e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  50.67 
 
 		 381 aa  344  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  51.87 
 
 		 380 aa  343  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  55.44 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  51.99 
 
 		 379 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  50.8 
 
 		 378 aa  340  2e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  49.47 
 
 		 383 aa  339  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  52.79 
 
 		 380 aa  339  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  51.47 
 
 		 381 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  52.8 
 
 		 381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  52.72 
 
 		 383 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  47.47 
 
 		 383 aa  333  4e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0185  glycerate kinase  50.67 
 
 		 381 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>