216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3280 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  100 
 
 		 379 aa  754    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  89.12 
 
 		 379 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  71.09 
 
 		 379 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  73.67 
 
 		 379 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  70.9 
 
 		 379 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  70.9 
 
 		 379 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  70.11 
 
 		 381 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  66.49 
 
 		 378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  63.03 
 
 		 381 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  57.33 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  63.03 
 
 		 380 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  61.97 
 
 		 381 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  58.05 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  52.53 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  52.53 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  52.53 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  52.8 
 
 		 377 aa  362  6e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  52.8 
 
 		 384 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  54.26 
 
 		 379 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  54.26 
 
 		 379 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  54.26 
 
 		 379 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  56.53 
 
 		 383 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  54.26 
 
 		 379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  50.83 
 
 		 380 aa  352  8e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  52.24 
 
 		 381 aa  350  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  52.39 
 
 		 377 aa  349  4e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  53.51 
 
 		 388 aa  346  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  49.21 
 
 		 379 aa  346  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  49.35 
 
 		 384 aa  344  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  50.53 
 
 		 378 aa  342  7e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  54.81 
 
 		 381 aa  342  8e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  54.19 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  47.95 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  50.4 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  49.47 
 
 		 392 aa  338  8e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  51.2 
 
 		 382 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  46.83 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  51.2 
 
 		 382 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  53.4 
 
 		 388 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  53.4 
 
 		 388 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  53.4 
 
 		 388 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  47.87 
 
 		 381 aa  331  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  48.28 
 
 		 381 aa  330  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  48.4 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  50.93 
 
 		 382 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  50.93 
 
 		 382 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  48.28 
 
 		 381 aa  329  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  46.3 
 
 		 381 aa  328  7e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  49.2 
 
 		 381 aa  328  7e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  46.03 
 
 		 385 aa  328  9e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  46.3 
 
 		 385 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  48.84 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  49.87 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  48.02 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  46.83 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  48.02 
 
 		 381 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  54.93 
 
 		 389 aa  327  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  48.02 
 
 		 381 aa  327  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  47.86 
 
 		 378 aa  327  3e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  48.02 
 
 		 381 aa  327  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  48.02 
 
 		 408 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  48.02 
 
 		 408 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  50.27 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  48.4 
 
 		 387 aa  325  7e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  53.51 
 
 		 379 aa  325  7e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  50.27 
 
 		 380 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  45.97 
 
 		 380 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  50.27 
 
 		 380 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  48.94 
 
 		 381 aa  324  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  45.77 
 
 		 381 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  46.9 
 
 		 386 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  45.77 
 
 		 381 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  50 
 
 		 380 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  50.27 
 
 		 381 aa  322  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  47.23 
 
 		 381 aa  322  9.000000000000001e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  50 
 
 		 380 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  49.61 
 
 		 384 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  45.33 
 
 		 383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  48.82 
 
 		 381 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  49.2 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  48.06 
 
 		 394 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  47.88 
 
 		 380 aa  318  1e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  46.68 
 
 		 380 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  46.68 
 
 		 380 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  47.01 
 
 		 402 aa  316  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  46.52 
 
 		 373 aa  316  5e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  46.52 
 
 		 373 aa  315  6e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  47.01 
 
 		 402 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  49.73 
 
 		 381 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  47.85 
 
 		 383 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  46.65 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  49.46 
 
 		 381 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  48.29 
 
 		 381 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  49.46 
 
 		 381 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  49.19 
 
 		 381 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  49.46 
 
 		 381 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  47.48 
 
 		 395 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  49.46 
 
 		 381 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  44.92 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  48.65 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>