216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2672 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  100 
 
 		 381 aa  750    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  91.29 
 
 		 379 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  91.03 
 
 		 379 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  86.17 
 
 		 379 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  74.54 
 
 		 379 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  70.45 
 
 		 379 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  70.11 
 
 		 379 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  68.09 
 
 		 378 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  65.17 
 
 		 380 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  65.52 
 
 		 381 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  65.52 
 
 		 381 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  52.8 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  51.34 
 
 		 378 aa  362  5.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  51.07 
 
 		 378 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  51.07 
 
 		 378 aa  359  6e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  52.91 
 
 		 381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  57.49 
 
 		 386 aa  355  8.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  54.32 
 
 		 383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  53.39 
 
 		 388 aa  352  8e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  56.84 
 
 		 381 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  51.86 
 
 		 387 aa  346  5e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  50.4 
 
 		 380 aa  345  8e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  51.6 
 
 		 377 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  52.94 
 
 		 384 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  53.66 
 
 		 380 aa  343  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  48.53 
 
 		 379 aa  342  9e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  50 
 
 		 380 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  50 
 
 		 380 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  50 
 
 		 380 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  51.6 
 
 		 381 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  49.74 
 
 		 380 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  49.21 
 
 		 384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  48.95 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  49.74 
 
 		 380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  56.55 
 
 		 388 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  51.74 
 
 		 381 aa  335  5e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  56.55 
 
 		 388 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  56.55 
 
 		 388 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  51.59 
 
 		 379 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  51.59 
 
 		 379 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  51.59 
 
 		 379 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  45.36 
 
 		 380 aa  334  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  51.59 
 
 		 379 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  55.71 
 
 		 394 aa  332  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  51.58 
 
 		 378 aa  332  6e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  55.83 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  47.63 
 
 		 380 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  51.76 
 
 		 380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  47.37 
 
 		 380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  50.94 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  47.16 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  50.95 
 
 		 379 aa  326  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  50.94 
 
 		 377 aa  326  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  49.49 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  50.67 
 
 		 381 aa  325  6e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  50.28 
 
 		 381 aa  325  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  50.28 
 
 		 381 aa  324  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  48.13 
 
 		 373 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  48.13 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  50 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  50 
 
 		 381 aa  322  7e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  50 
 
 		 381 aa  322  7e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  50 
 
 		 381 aa  322  7e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  50 
 
 		 408 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  50 
 
 		 408 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  51.25 
 
 		 395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  44.47 
 
 		 381 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  48.22 
 
 		 402 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  53.66 
 
 		 379 aa  318  7.999999999999999e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  48.69 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  44.53 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  49.2 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  49.15 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  49.2 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  47.18 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  49.08 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  49.2 
 
 		 382 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  49.2 
 
 		 382 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  45.45 
 
 		 380 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  45.45 
 
 		 380 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  51.6 
 
 		 384 aa  316  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  48.75 
 
 		 380 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  47.85 
 
 		 403 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  44.21 
 
 		 381 aa  316  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  45.33 
 
 		 386 aa  315  7e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  45 
 
 		 381 aa  315  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  43.68 
 
 		 385 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  51.21 
 
 		 381 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  43.01 
 
 		 383 aa  313  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  43.68 
 
 		 385 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  50 
 
 		 381 aa  312  6.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  43.68 
 
 		 381 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  44.44 
 
 		 381 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1570  glycerate kinase  49.24 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.769204  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  45.72 
 
 		 378 aa  309  6.999999999999999e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  48.42 
 
 		 384 aa  308  9e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  45.36 
 
 		 378 aa  304  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  48.38 
 
 		 381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  48.67 
 
 		 381 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0185  glycerate kinase  43.95 
 
 		 381 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>