215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2549 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2549  glycerate kinase  100 
 
 		 385 aa  740    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  59.79 
 
 		 375 aa  349  5e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3130  glycerate kinase  55.5 
 
 		 377 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00415476  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  54.92 
 
 		 397 aa  302  8.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  49.33 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3439  Glycerate kinase  52.47 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  48.32 
 
 		 380 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  53.52 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3692  glycerate kinase  50.5 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  49.06 
 
 		 388 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  49.06 
 
 		 388 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  49.06 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  47.18 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  48.52 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  47.71 
 
 		 379 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  47.99 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  46.19 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2777  Glycerate kinase  52.15 
 
 		 421 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14280  glycerate kinase  49.74 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000570843  normal  0.0813973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  53.18 
 
 		 381 aa  272  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  43.9 
 
 		 380 aa  272  9e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  49.86 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  46.52 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  44.12 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  45.41 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  44.53 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  46.22 
 
 		 379 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  45.21 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  44.27 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  44.27 
 
 		 381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  48.62 
 
 		 381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  44.27 
 
 		 381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  48.62 
 
 		 381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  44.27 
 
 		 381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  44.27 
 
 		 408 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  44.27 
 
 		 408 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  46.18 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  48.62 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  48.62 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08140  glycerate kinase  52.86 
 
 		 401 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  50.13 
 
 		 381 aa  266  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1476  glycerate kinase  55.26 
 
 		 377 aa  265  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  48.62 
 
 		 381 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  44.95 
 
 		 380 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  48.62 
 
 		 381 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  44.68 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  46 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  44.95 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  44.27 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  49.19 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  48.31 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0243  glycerate kinase  52.23 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  46.72 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  46.72 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  48.31 
 
 		 381 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  46.72 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  46.72 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  44 
 
 		 381 aa  263  4.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  44.68 
 
 		 380 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  43.58 
 
 		 387 aa  262  8.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  41.46 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  45.79 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  38.36 
 
 		 380 aa  260  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  44.93 
 
 		 402 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  46.9 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  43.6 
 
 		 373 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  41.24 
 
 		 379 aa  258  9e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  46.9 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  46.22 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4821  glycerate kinase  51.48 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  47.03 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  52.6 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  44 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  47.06 
 
 		 380 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  43.26 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  47.7 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  43.88 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  43.72 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  44.11 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  44.15 
 
 		 381 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  43.28 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  45.28 
 
 		 381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  41.94 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  42.13 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  44.41 
 
 		 379 aa  252  8.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  40.97 
 
 		 385 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  42.86 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  38.71 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  41.82 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  45 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  42.86 
 
 		 378 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  40.97 
 
 		 385 aa  249  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  42.86 
 
 		 377 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  41.67 
 
 		 381 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  40.97 
 
 		 381 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  47.03 
 
 		 381 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  46.76 
 
 		 379 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  44.5 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  44.5 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  44.5 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>