215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4821 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4821  glycerate kinase  100 
 
 		 377 aa  724    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  54.47 
 
 		 375 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3130  glycerate kinase  50.8 
 
 		 377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00415476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2549  glycerate kinase  51.48 
 
 		 385 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3439  Glycerate kinase  47.09 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  42.86 
 
 		 382 aa  252  9.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0243  glycerate kinase  49.08 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3692  glycerate kinase  46.56 
 
 		 409 aa  250  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1476  glycerate kinase  53.24 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  42.74 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  38.77 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  45.14 
 
 		 381 aa  239  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  47.28 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14280  glycerate kinase  48.81 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000570843  normal  0.0813973 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  45.78 
 
 		 380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  37.4 
 
 		 381 aa  236  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  41.21 
 
 		 384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  47.67 
 
 		 397 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  40.7 
 
 		 380 aa  232  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  39.63 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  39.05 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  42.52 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  38.73 
 
 		 381 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  46.28 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  40.67 
 
 		 377 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  39.36 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  38.17 
 
 		 373 aa  229  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  39.31 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  43.24 
 
 		 379 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  43.63 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  41 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  39.05 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  38.17 
 
 		 373 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08140  glycerate kinase  45.61 
 
 		 401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  37.5 
 
 		 379 aa  226  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  40.32 
 
 		 378 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  40.11 
 
 		 381 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  44.53 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  41.84 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  41.95 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  37.23 
 
 		 383 aa  223  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  40.05 
 
 		 378 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  43.42 
 
 		 378 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  39.79 
 
 		 378 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  40.63 
 
 		 381 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  41.31 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  43.47 
 
 		 379 aa  222  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  41.67 
 
 		 381 aa  222  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  48.01 
 
 		 381 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  41.67 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  41.67 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  41.67 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  41.67 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  39.43 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  39.43 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  40 
 
 		 378 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  41.67 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  43.24 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  41.38 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  39.55 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  40.87 
 
 		 379 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  40.87 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  40.87 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  40.58 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  40.11 
 
 		 381 aa  219  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  42.18 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  42.18 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  42.64 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  45.77 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  42.18 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  41.9 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  42.11 
 
 		 380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  39.21 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  45.77 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  40.48 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  40.17 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  42.64 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  45.48 
 
 		 388 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  42.64 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  45.19 
 
 		 394 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  41.9 
 
 		 380 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  40.23 
 
 		 381 aa  215  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  42.33 
 
 		 381 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  42.33 
 
 		 381 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  43.27 
 
 		 381 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0572  glycerate kinase  44.77 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0411866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0185  glycerate kinase  38.73 
 
 		 381 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  41.44 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  42.33 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  42.33 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3045  glycerate kinase  36.93 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0181471 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  41.04 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  41.04 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1163  glycerate kinase  45.89 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  40.23 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  41.27 
 
 		 380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  42.02 
 
 		 381 aa  212  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  40.46 
 
 		 381 aa  212  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  39.32 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  43.57 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>