217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0243 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0243  glycerate kinase  100 
 
 		 377 aa  710    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  62.37 
 
 		 375 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3130  glycerate kinase  55.61 
 
 		 377 aa  322  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00415476  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3439  Glycerate kinase  54.29 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3692  glycerate kinase  53.63 
 
 		 409 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  52.07 
 
 		 397 aa  304  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1476  glycerate kinase  61.5 
 
 		 377 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2777  Glycerate kinase  52.52 
 
 		 421 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08140  glycerate kinase  50.65 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0440  Glycerate kinase  47.52 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14280  glycerate kinase  49.21 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000570843  normal  0.0813973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  45.79 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  43.24 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2549  glycerate kinase  52.24 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  42.71 
 
 		 379 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  43.88 
 
 		 382 aa  255  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  43.5 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  46.22 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4821  glycerate kinase  51.19 
 
 		 377 aa  252  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  44.59 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  44.27 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  47.13 
 
 		 377 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  46.83 
 
 		 377 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  40.83 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  46.53 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  47.58 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  47.96 
 
 		 380 aa  242  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  42.45 
 
 		 380 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  45.32 
 
 		 378 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  45.71 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  38.04 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  39.6 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  44.71 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  40.06 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  45.02 
 
 		 378 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  41.69 
 
 		 394 aa  236  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  41.84 
 
 		 381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  44.59 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  39.6 
 
 		 373 aa  236  7e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  45.92 
 
 		 384 aa  235  9e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  44.41 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2626  glycerate kinase  49.87 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12960  glycerate kinase  45.5 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  44.71 
 
 		 381 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  44.71 
 
 		 381 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  47.14 
 
 		 381 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  45.02 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  45.02 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  44.71 
 
 		 381 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  44.71 
 
 		 381 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  44.41 
 
 		 381 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  44.41 
 
 		 381 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  44.41 
 
 		 381 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4727  glycerate kinase  55.11 
 
 		 511 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  42.31 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0572  glycerate kinase  45.87 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0411866  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  40.24 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  41.4 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  44.11 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  40.42 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  44.11 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0239  Glycerate kinase  46.09 
 
 		 374 aa  230  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  41.87 
 
 		 395 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  43.81 
 
 		 380 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  36.72 
 
 		 378 aa  229  6e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  44.71 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  43.81 
 
 		 380 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  44.71 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  40.42 
 
 		 381 aa  229  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  40.28 
 
 		 402 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  45.33 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  47.73 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  44.11 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  41.99 
 
 		 381 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  40 
 
 		 402 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  44.71 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  43.81 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  43.78 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  35.9 
 
 		 384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  45.85 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  45.85 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  47.27 
 
 		 388 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  42.3 
 
 		 380 aa  225  9e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  50.6 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  38.42 
 
 		 381 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  42.9 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  41.09 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  37.22 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20350  glycerate kinase  46.54 
 
 		 383 aa  224  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  39.61 
 
 		 403 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  35.09 
 
 		 380 aa  222  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  48.79 
 
 		 381 aa  222  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  42.54 
 
 		 378 aa  222  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  36.91 
 
 		 389 aa  222  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  37.22 
 
 		 385 aa  222  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  37.22 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  35.28 
 
 		 381 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  37.22 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  42.6 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  42.6 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>