216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0572 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0572  glycerate kinase  100 
 
 		 384 aa  724    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0411866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  40.59 
 
 		 380 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  35.48 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  43.43 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  41.33 
 
 		 380 aa  235  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  40.54 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  42.9 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  40.27 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  40.27 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  40.27 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  40.27 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  40.27 
 
 		 408 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  40.27 
 
 		 408 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  40.27 
 
 		 381 aa  233  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  40.54 
 
 		 381 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  45.69 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  41.82 
 
 		 379 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  45.95 
 
 		 375 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  46.96 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  43.09 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  46.96 
 
 		 388 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  46.96 
 
 		 388 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  41.55 
 
 		 379 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  42.4 
 
 		 379 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  42.4 
 
 		 379 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  39.14 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  39.46 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  42.82 
 
 		 379 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  42.4 
 
 		 379 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  47.81 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  45.43 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  38.87 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  39.14 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  41.71 
 
 		 379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  39.19 
 
 		 387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  36.7 
 
 		 383 aa  226  6e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  39.83 
 
 		 381 aa  226  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  38.54 
 
 		 373 aa  225  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  42.47 
 
 		 378 aa  225  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  39.83 
 
 		 379 aa  225  8e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  40.11 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  39.66 
 
 		 380 aa  224  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  42.25 
 
 		 382 aa  223  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  39.62 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  40.29 
 
 		 381 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  39.14 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  38.27 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  37.74 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  44.77 
 
 		 378 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  37.63 
 
 		 402 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  43.02 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  39.84 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  40.64 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12960  glycerate kinase  46.07 
 
 		 375 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  42.02 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3692  glycerate kinase  44.09 
 
 		 409 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  38.28 
 
 		 383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  36.87 
 
 		 378 aa  215  9e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  45.04 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3130  glycerate kinase  45.41 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00415476  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  39.83 
 
 		 381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  36.46 
 
 		 381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  41.62 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  39.35 
 
 		 380 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  45.17 
 
 		 385 aa  212  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  39.08 
 
 		 380 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  37.03 
 
 		 402 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  38.13 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  39.68 
 
 		 380 aa  212  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  42.36 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  39.08 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  46.94 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2549  glycerate kinase  45.8 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  39.08 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  39.2 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  39.53 
 
 		 384 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1570  glycerate kinase  38.11 
 
 		 403 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.769204  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  36.8 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3439  Glycerate kinase  41.36 
 
 		 398 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  41.98 
 
 		 382 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  41.98 
 
 		 382 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  35.39 
 
 		 384 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  35.37 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  38.81 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  39.63 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1476  glycerate kinase  49.46 
 
 		 377 aa  206  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0243  glycerate kinase  45.87 
 
 		 377 aa  206  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  35.64 
 
 		 385 aa  205  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  42.09 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  35.64 
 
 		 381 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  36.9 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14280  glycerate kinase  42.02 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000570843  normal  0.0813973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  37.43 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  35.37 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4863  glycerate kinase GcxK  38.3 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432659  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  41.4 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  41.67 
 
 		 382 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  41.67 
 
 		 382 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4561  glycerate kinase  41.74 
 
 		 387 aa  202  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.532738 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  34.49 
 
 		 380 aa  202  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>