216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4863 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4863  glycerate kinase GcxK  100 
 
 		 380 aa  773    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432659  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  48.53 
 
 		 378 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  48.27 
 
 		 378 aa  332  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  48.27 
 
 		 378 aa  332  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  48.94 
 
 		 384 aa  324  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  46.77 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  46.77 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  46.77 
 
 		 382 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  46.77 
 
 		 382 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  48.66 
 
 		 382 aa  322  8e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  47.58 
 
 		 381 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  48.12 
 
 		 380 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  47.85 
 
 		 381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  47.58 
 
 		 381 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  46.07 
 
 		 380 aa  319  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  49.19 
 
 		 381 aa  319  5e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  47.31 
 
 		 388 aa  319  6e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  49.19 
 
 		 381 aa  318  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  49.19 
 
 		 408 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  49.19 
 
 		 381 aa  318  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  49.19 
 
 		 408 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  49.19 
 
 		 381 aa  318  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  46.81 
 
 		 378 aa  318  9e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  49.19 
 
 		 381 aa  318  9e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  47.58 
 
 		 381 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  47.58 
 
 		 381 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  47.34 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  48.92 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  47.58 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  47.58 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  48.66 
 
 		 381 aa  317  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  47.31 
 
 		 381 aa  316  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  48.14 
 
 		 379 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  48.14 
 
 		 379 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  48.14 
 
 		 379 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  48.14 
 
 		 379 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  46.77 
 
 		 387 aa  315  8e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  45.16 
 
 		 380 aa  315  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  47.58 
 
 		 377 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  48.2 
 
 		 380 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  48.66 
 
 		 381 aa  313  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  46.58 
 
 		 384 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  47.04 
 
 		 381 aa  311  9e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  46.83 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  47.91 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  45.16 
 
 		 383 aa  308  9e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  47.58 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  45.6 
 
 		 379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  46.7 
 
 		 381 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  46.15 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  46.95 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  47.47 
 
 		 381 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  45.97 
 
 		 381 aa  301  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  45.7 
 
 		 381 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  45.26 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  45.89 
 
 		 380 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  45.89 
 
 		 380 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  49.29 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  43.29 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  45.89 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  44.35 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  44 
 
 		 381 aa  296  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  44 
 
 		 381 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  46.01 
 
 		 379 aa  295  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  43.67 
 
 		 373 aa  295  9e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  45.62 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  46.84 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  45.97 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  45.97 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  43.67 
 
 		 373 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  45.96 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  43.58 
 
 		 384 aa  292  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  43.47 
 
 		 385 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  42.29 
 
 		 380 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  43.47 
 
 		 381 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  43.2 
 
 		 385 aa  289  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  45.43 
 
 		 394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0185  glycerate kinase  45.43 
 
 		 381 aa  285  9e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  48.12 
 
 		 379 aa  285  9e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  43.47 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  44 
 
 		 381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  42.82 
 
 		 386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  42.19 
 
 		 389 aa  281  9e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  45.16 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  45.16 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  45.16 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  43.01 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  43.58 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  49.01 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  46.09 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  42.36 
 
 		 378 aa  278  8e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  44.15 
 
 		 379 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  44.03 
 
 		 384 aa  277  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  43.05 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  43.2 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  45.21 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  45.74 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  43.85 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  44.66 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  41.27 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>