216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0239 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0239  Glycerate kinase  100 
 
 
374 aa  719    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0123  glycerate kinase  88.5 
 
 
374 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12960  glycerate kinase  45.7 
 
 
375 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  45.58 
 
 
383 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  46.99 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  44.89 
 
 
379 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  46.17 
 
 
379 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  44.6 
 
 
378 aa  250  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  44.5 
 
 
382 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  44.5 
 
 
382 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  48.87 
 
 
378 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  44.5 
 
 
382 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  44.5 
 
 
382 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  44.32 
 
 
378 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  39.95 
 
 
373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  45.9 
 
 
379 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  44.04 
 
 
378 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  45.48 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  42.47 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  43.01 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  43.01 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  43.01 
 
 
381 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  43.01 
 
 
381 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  41.4 
 
 
387 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  45.11 
 
 
381 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  43.01 
 
 
381 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  43.01 
 
 
408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  43.01 
 
 
408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  39.68 
 
 
373 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  43.01 
 
 
379 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  43.05 
 
 
379 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  41.4 
 
 
381 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  43.28 
 
 
379 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  43.28 
 
 
379 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  39.25 
 
 
380 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  39.25 
 
 
380 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  45.48 
 
 
379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  45.9 
 
 
380 aa  240  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  42.2 
 
 
381 aa  238  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  43.22 
 
 
383 aa  237  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  47.74 
 
 
381 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  44.38 
 
 
382 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  45.63 
 
 
379 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  40.4 
 
 
381 aa  235  8e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  45.15 
 
 
379 aa  235  8e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  40.74 
 
 
386 aa  235  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3130  glycerate kinase  47.45 
 
 
377 aa  235  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00415476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  43.92 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  41.67 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  41.33 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  46.45 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  41.4 
 
 
380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  41.4 
 
 
380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  47.53 
 
 
380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  40.97 
 
 
381 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  43.28 
 
 
384 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  41.13 
 
 
380 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  42.09 
 
 
380 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  42.47 
 
 
380 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  44.5 
 
 
384 aa  230  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  40.11 
 
 
384 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  41.13 
 
 
380 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  42.71 
 
 
381 aa  229  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  42.71 
 
 
381 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  42.71 
 
 
381 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3439  Glycerate kinase  46.34 
 
 
398 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  42.59 
 
 
381 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  41.87 
 
 
380 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  44.57 
 
 
381 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  44.57 
 
 
381 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  44.09 
 
 
388 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  43.24 
 
 
381 aa  228  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  39.76 
 
 
389 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  36.53 
 
 
380 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  44.09 
 
 
388 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  41.55 
 
 
381 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  42.71 
 
 
381 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  43.55 
 
 
394 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  44.09 
 
 
388 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  41.02 
 
 
392 aa  225  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  42.18 
 
 
381 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  48.02 
 
 
381 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  42.73 
 
 
380 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  40.32 
 
 
381 aa  224  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  41.53 
 
 
381 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  41.26 
 
 
381 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  40.47 
 
 
394 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3692  glycerate kinase  44.71 
 
 
409 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  41.32 
 
 
379 aa  222  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  40.84 
 
 
394 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  44.2 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1024  glycerate kinase  43.33 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2549  glycerate kinase  46.49 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  41.49 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1342  glycerate kinase  43.03 
 
 
378 aa  220  3e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  40.59 
 
 
388 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  44.85 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14280  glycerate kinase  43.73 
 
 
396 aa  219  6e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000570843  normal  0.0813973 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  39.55 
 
 
381 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  39.55 
 
 
385 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>