215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0123 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0123  glycerate kinase  100 
 
 		 374 aa  718    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0239  Glycerate kinase  88.5 
 
 		 374 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  46.92 
 
 		 383 aa  276  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12960  glycerate kinase  47.58 
 
 		 375 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  46.91 
 
 		 378 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  46.63 
 
 		 378 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  46.35 
 
 		 378 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  43.82 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  43.82 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  47.15 
 
 		 375 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  44.39 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  46.3 
 
 		 379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  43.55 
 
 		 381 aa  259  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  43.55 
 
 		 381 aa  258  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  43.55 
 
 		 381 aa  258  9e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  43.55 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  43.55 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  43.55 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  43.55 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  43.55 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  46.77 
 
 		 379 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  40.54 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  43.55 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  43.55 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  43.55 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  45.7 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  43.55 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  45.79 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  40.48 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  40.27 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  40.27 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  46.07 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  46.07 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  42.74 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  42.09 
 
 		 380 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  45.81 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  46.58 
 
 		 379 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  46.03 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  42.47 
 
 		 380 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  44.24 
 
 		 380 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  42.2 
 
 		 380 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  42.2 
 
 		 380 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  40.21 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  43.82 
 
 		 384 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  41.94 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  43.13 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  45.21 
 
 		 379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  43.97 
 
 		 380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  41.94 
 
 		 380 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  37.37 
 
 		 380 aa  245  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  40.21 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  43.99 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  48.41 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  43.2 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  42.74 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  47.4 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  42.94 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  46.58 
 
 		 379 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  47.12 
 
 		 378 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  41.76 
 
 		 378 aa  239  5.999999999999999e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3692  glycerate kinase  46.21 
 
 		 409 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  43.17 
 
 		 381 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  44.06 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3130  glycerate kinase  46.63 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00415476  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  40.86 
 
 		 381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  43.32 
 
 		 381 aa  235  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  46.85 
 
 		 380 aa  236  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  42.48 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  42.48 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  45.82 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3439  Glycerate kinase  46.34 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  37.33 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  42.48 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  42.48 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  42.22 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  42.37 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  41.67 
 
 		 379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  41.29 
 
 		 392 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  41.95 
 
 		 381 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  40.86 
 
 		 381 aa  232  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  40.59 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  41.95 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  43.24 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4561  glycerate kinase  43.05 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.532738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  43.35 
 
 		 384 aa  229  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  41.67 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  43.55 
 
 		 388 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  43.28 
 
 		 379 aa  229  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  43.55 
 
 		 388 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  43.55 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  39.83 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  41.83 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  45.38 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  40.11 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  38.44 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  38.17 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  41.3 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  44.89 
 
 		 389 aa  226  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  41.74 
 
 		 389 aa  226  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  48.13 
 
 		 381 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>