216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1372 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1372  glycerate kinase  100 
 
 		 397 aa  805    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125606 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1342  glycerate kinase  58.19 
 
 		 378 aa  426  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1024  glycerate kinase  57.18 
 
 		 378 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  44.81 
 
 		 378 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  44.81 
 
 		 378 aa  299  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  44.81 
 
 		 378 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  45.11 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  44.72 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  52.25 
 
 		 384 aa  290  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  42.14 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  44.42 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  44.53 
 
 		 395 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  50.15 
 
 		 394 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  43.89 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  44.08 
 
 		 388 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  44.08 
 
 		 388 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  44.08 
 
 		 388 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  45.86 
 
 		 381 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  43.32 
 
 		 394 aa  286  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  44.61 
 
 		 381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  43.94 
 
 		 381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  42.38 
 
 		 402 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  44.84 
 
 		 380 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  43.81 
 
 		 380 aa  282  8.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  45.11 
 
 		 381 aa  282  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  44.08 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  42.28 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  44.78 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  44.78 
 
 		 392 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  42.96 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  42.14 
 
 		 402 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  50.45 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  48.07 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  43.36 
 
 		 382 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  43.36 
 
 		 382 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  44.56 
 
 		 384 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  42.96 
 
 		 380 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  43.81 
 
 		 379 aa  275  7e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  42.36 
 
 		 381 aa  275  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  42.61 
 
 		 381 aa  275  9e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  42.61 
 
 		 381 aa  275  9e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  42.46 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  42.71 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  42.71 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  43.18 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  43.11 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  43.11 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  42.36 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  42.68 
 
 		 381 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  42.36 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  42.68 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  43.22 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  42.36 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  42.36 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  44.68 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  43.5 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  42.42 
 
 		 381 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  40.7 
 
 		 381 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  48.65 
 
 		 378 aa  270  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  42.42 
 
 		 408 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  42.42 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  42.42 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  42.42 
 
 		 408 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  42.42 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  40.56 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  42.46 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  42.35 
 
 		 380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  42.35 
 
 		 380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  41.92 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1570  glycerate kinase  42.24 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.769204  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  40.36 
 
 		 380 aa  265  8e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  45.95 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  46.93 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  40.3 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  40.3 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  40.5 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  40.3 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  40.25 
 
 		 381 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  40.25 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  41.75 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  40.3 
 
 		 379 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  43.07 
 
 		 380 aa  262  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  40.25 
 
 		 381 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  40.5 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  44.67 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1135  glycerate kinase  46.48 
 
 		 374 aa  255  7e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  44.28 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  48.78 
 
 		 383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  41.92 
 
 		 381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  45.05 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  44.88 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  47.13 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  46.04 
 
 		 380 aa  249  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  43.73 
 
 		 380 aa  249  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  43.07 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  38.25 
 
 		 380 aa  249  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  49.25 
 
 		 381 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  46.65 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  44.65 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  45.18 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>