215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3305 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3305  glycerate kinase  100 
 
 		 378 aa  705    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3537  glycerate kinase  87.57 
 
 		 386 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181581  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4147  glycerate kinase  63.3 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.676652  decreased coverage  0.00778507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1010  glycerate kinase  57.41 
 
 		 363 aa  301  9e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0956  glycerate kinase  57.85 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.421654 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  43.25 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  45.71 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1372  glycerate kinase  44.65 
 
 		 397 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  40.79 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1660  glycerate kinase  46.44 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.162616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  45.27 
 
 		 381 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  39.19 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  43.6 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  48.17 
 
 		 388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  48.17 
 
 		 388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  48.17 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  43.3 
 
 		 379 aa  212  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  41.13 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  44.25 
 
 		 381 aa  210  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1024  glycerate kinase  41.9 
 
 		 378 aa  209  5e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  38.16 
 
 		 383 aa  209  6e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1342  glycerate kinase  41.34 
 
 		 378 aa  209  9e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  46.95 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  45.38 
 
 		 378 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  39.84 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  36.48 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  41.88 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  41.33 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  41.33 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  40.67 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  37.54 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  41.33 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  38.46 
 
 		 381 aa  206  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  46.13 
 
 		 381 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  46.67 
 
 		 385 aa  205  9e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  40.36 
 
 		 379 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  37.99 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  40.18 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  42.02 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  36.22 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  43.19 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  40.89 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  35.84 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  41.04 
 
 		 380 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3147  glycerate kinase  50.53 
 
 		 357 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  40.67 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  42.51 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  44.72 
 
 		 353 aa  203  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  38.58 
 
 		 379 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  38.85 
 
 		 379 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  38.85 
 
 		 379 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  41.5 
 
 		 380 aa  202  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  37.27 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12960  glycerate kinase  44.3 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2001  glycerate kinase  44.16 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2047  glycerate kinase  44.16 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1926  glycerate kinase  38.08 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  36.39 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  44.85 
 
 		 384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  42.49 
 
 		 383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  38.58 
 
 		 379 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  44.56 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  37.78 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  45.32 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  43.41 
 
 		 381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  37.65 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  37.65 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  39.58 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  40.67 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  37.65 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  37.65 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  37.65 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  37.65 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  37.88 
 
 		 408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  37.88 
 
 		 408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4863  glycerate kinase GcxK  40.73 
 
 		 380 aa  196  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432659  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  38.9 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  39.71 
 
 		 380 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  41.1 
 
 		 388 aa  196  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1982  glycerate kinase  43.64 
 
 		 369 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0239  Glycerate kinase  45.38 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  38.9 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  40.89 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  37.88 
 
 		 381 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  37.05 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  34.77 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  36.48 
 
 		 378 aa  193  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  38.33 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  36.73 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  37.36 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2253  glycerate kinase  38.04 
 
 		 380 aa  189  7e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.453069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  36 
 
 		 384 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0612  glycerate kinase 1  37.46 
 
 		 377 aa  189  8e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  36.89 
 
 		 385 aa  189  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2626  glycerate kinase  44.67 
 
 		 403 aa  189  9e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  37.89 
 
 		 377 aa  189  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4457  glycerate kinase  43.04 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2233  glycerate kinase  38.48 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  36.89 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  37.5 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>