215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0612 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0612  glycerate kinase 1  100 
 
 
377 aa  750    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  52.8 
 
 
380 aa  376  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  50.92 
 
 
381 aa  340  2e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  49.44 
 
 
384 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  45.36 
 
 
380 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  45.36 
 
 
380 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2253  glycerate kinase  47.63 
 
 
380 aa  289  6e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.453069  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1859  glycerate kinase family protein  45.57 
 
 
386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  47.75 
 
 
380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  43.51 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  44.54 
 
 
383 aa  281  9e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  44.24 
 
 
395 aa  281  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  42.74 
 
 
402 aa  282  9e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  43.73 
 
 
379 aa  281  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  42.48 
 
 
402 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  42.11 
 
 
403 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  42.2 
 
 
394 aa  279  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2071  glycerate kinase  46.52 
 
 
377 aa  279  6e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000043752  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  44.72 
 
 
389 aa  278  9e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  42.93 
 
 
379 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  44.32 
 
 
384 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  42.67 
 
 
379 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  42.67 
 
 
379 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  42.67 
 
 
379 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  44.85 
 
 
381 aa  276  3e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  43.3 
 
 
381 aa  276  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  44.21 
 
 
381 aa  276  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  42.52 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  41.58 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  44.59 
 
 
380 aa  272  5.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  43.02 
 
 
381 aa  272  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1570  glycerate kinase  42.22 
 
 
403 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.769204  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  41.01 
 
 
394 aa  272  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  41.32 
 
 
378 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  41.32 
 
 
378 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  42.78 
 
 
381 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  42.55 
 
 
389 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  43.7 
 
 
383 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  42.22 
 
 
382 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  42.22 
 
 
382 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  42.22 
 
 
378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  43.65 
 
 
388 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  43.63 
 
 
394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  42.89 
 
 
380 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  43.65 
 
 
388 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  43.65 
 
 
388 aa  269  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  43.58 
 
 
381 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  44.97 
 
 
381 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  41.95 
 
 
382 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  41.95 
 
 
382 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  40.93 
 
 
392 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1135  glycerate kinase  45.93 
 
 
374 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  42.48 
 
 
382 aa  265  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  42.28 
 
 
380 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  43.66 
 
 
381 aa  265  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  42.4 
 
 
377 aa  265  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  42.49 
 
 
381 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  42.16 
 
 
380 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  42.16 
 
 
380 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  43.66 
 
 
381 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  43.66 
 
 
381 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  43.36 
 
 
380 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  43.66 
 
 
381 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  44.23 
 
 
381 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  41.89 
 
 
380 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  42.48 
 
 
378 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  41.71 
 
 
384 aa  262  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  43.66 
 
 
381 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  43.38 
 
 
381 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  43.38 
 
 
381 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  41.99 
 
 
381 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  41.94 
 
 
386 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  41.62 
 
 
385 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  41.62 
 
 
385 aa  259  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  42.48 
 
 
380 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  41.62 
 
 
381 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  42.55 
 
 
379 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  41.73 
 
 
380 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  41.99 
 
 
381 aa  259  7e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  44.38 
 
 
380 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  43.01 
 
 
381 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  40.63 
 
 
377 aa  256  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  41.47 
 
 
381 aa  255  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  43.54 
 
 
381 aa  255  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  43.54 
 
 
381 aa  255  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  43.54 
 
 
381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  44.03 
 
 
381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  43.54 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  43.54 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  43.54 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  43.54 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  40.58 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  43.54 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2611  glycerate kinase  43.89 
 
 
376 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  42.22 
 
 
380 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  42.56 
 
 
381 aa  252  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24350  glycerate kinase  42.78 
 
 
376 aa  251  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  42.98 
 
 
381 aa  250  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  40.94 
 
 
379 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  43.26 
 
 
379 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>