216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4147 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4147  glycerate kinase  100 
 
 		 372 aa  725    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.676652  decreased coverage  0.00778507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3537  glycerate kinase  64.1 
 
 		 386 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181581  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3305  glycerate kinase  63.3 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0956  glycerate kinase  57.8 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.421654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1010  glycerate kinase  52.15 
 
 		 363 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1660  glycerate kinase  49.49 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.162616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  39.89 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  42.93 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  39.89 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  39.89 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  44.8 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  47.56 
 
 		 394 aa  229  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  47.56 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  47.56 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  47.26 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1372  glycerate kinase  43.12 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125606 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  38.62 
 
 		 377 aa  225  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  41.45 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  44.75 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  41.11 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  44.27 
 
 		 381 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1342  glycerate kinase  38.68 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  42.58 
 
 		 381 aa  222  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  42.58 
 
 		 381 aa  222  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  42.02 
 
 		 379 aa  222  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  42.58 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  42.58 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  42.58 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1024  glycerate kinase  40.97 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  42.58 
 
 		 381 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  42.58 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  43.47 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  42.58 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  41.05 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  41.76 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  37.6 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  37.6 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  37.6 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  42.02 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  41.07 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  40.22 
 
 		 373 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  41.76 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  40.18 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  37.33 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  40.22 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  39.22 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  38.03 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  39.22 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  38.56 
 
 		 381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  41.49 
 
 		 379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0239  Glycerate kinase  45.19 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  41.74 
 
 		 381 aa  212  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12960  glycerate kinase  41.89 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  37.07 
 
 		 378 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  37.87 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  37.88 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  44.02 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  42.94 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  37.87 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  40.24 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  37.87 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  37.87 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  39.01 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  39.01 
 
 		 380 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  37.2 
 
 		 392 aa  209  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  41.49 
 
 		 379 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  41.07 
 
 		 378 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  39.01 
 
 		 380 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  42.29 
 
 		 381 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  38.91 
 
 		 383 aa  209  9e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  41.18 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  41.76 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  38.56 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2071  glycerate kinase  37.39 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000043752  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  37.2 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  40.98 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  38.74 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  37.27 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  38.74 
 
 		 380 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  44 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  38.3 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  39.41 
 
 		 380 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5723  glycerate kinase  40.75 
 
 		 397 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  41.51 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  35.15 
 
 		 381 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  36.7 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1926  glycerate kinase  36.24 
 
 		 371 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  36.44 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  34.2 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3065  glycerate kinase  44.8 
 
 		 359 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.831478  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  36.73 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2001  glycerate kinase  42.2 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  35.42 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2047  glycerate kinase  42.2 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  42.9 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  36.17 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  35.9 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  38.4 
 
 		 384 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  40.77 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  34.29 
 
 		 402 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>