217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1010 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1010  glycerate kinase  100 
 
 		 363 aa  696    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0956  glycerate kinase  69.7 
 
 		 373 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.421654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3537  glycerate kinase  56.35 
 
 		 386 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181581  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1660  glycerate kinase  54.03 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.162616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4147  glycerate kinase  51.32 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.676652  decreased coverage  0.00778507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  45.14 
 
 		 382 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3305  glycerate kinase  57.14 
 
 		 378 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  42.7 
 
 		 378 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  42.7 
 
 		 378 aa  262  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  48.77 
 
 		 381 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  42.43 
 
 		 378 aa  260  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  44.39 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  43.78 
 
 		 384 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  42.82 
 
 		 380 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  45.97 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  41.3 
 
 		 387 aa  245  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  41.85 
 
 		 381 aa  245  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  40.94 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  43.21 
 
 		 380 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  40.81 
 
 		 379 aa  243  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  40.33 
 
 		 380 aa  242  6e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  41.44 
 
 		 377 aa  242  7e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  45.5 
 
 		 381 aa  242  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  45.65 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  44.86 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  43.17 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  43.78 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  44.29 
 
 		 381 aa  239  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  44.32 
 
 		 379 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  43.9 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  39.19 
 
 		 383 aa  235  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  44.29 
 
 		 379 aa  235  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  41.5 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  36.96 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  40.49 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  39.52 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  40.53 
 
 		 392 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  42.05 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  41.62 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  38.92 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  39.19 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  41.78 
 
 		 379 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  41.5 
 
 		 373 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  39.19 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  42.05 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  42.05 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  43.09 
 
 		 380 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  38.92 
 
 		 385 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  38.81 
 
 		 385 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  41.42 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  38.04 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3147  glycerate kinase  53.44 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  43.27 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  38.86 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  41.6 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  44.96 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  39.62 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  38.65 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  40.81 
 
 		 379 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  36.41 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  45.78 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  38.48 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  45.78 
 
 		 388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  45.78 
 
 		 388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  37.77 
 
 		 381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  37.77 
 
 		 381 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  39.19 
 
 		 380 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  39.19 
 
 		 380 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  39.19 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  43.51 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1342  glycerate kinase  37.6 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  37.77 
 
 		 408 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  37.77 
 
 		 381 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12960  glycerate kinase  46.01 
 
 		 375 aa  223  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  37.77 
 
 		 381 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  37.77 
 
 		 408 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  37.77 
 
 		 381 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  43.51 
 
 		 379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  36.76 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  39.74 
 
 		 394 aa  222  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  40.8 
 
 		 402 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  37.22 
 
 		 402 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  38.5 
 
 		 381 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  38.92 
 
 		 380 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  42.49 
 
 		 403 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  38.5 
 
 		 381 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  43.51 
 
 		 381 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  40 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  39.48 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  38.92 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  37.23 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3065  glycerate kinase  45.87 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.831478  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  40.76 
 
 		 388 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  40.6 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  43.78 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1024  glycerate kinase  37.33 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3569  glycerate kinase  47.55 
 
 		 353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.581424  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  40.64 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  34.43 
 
 		 384 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  45 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>