215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3065 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3065  glycerate kinase  100 
 
 		 359 aa  681    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.831478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3569  glycerate kinase  63.9 
 
 		 353 aa  335  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.581424  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2944  glycerate kinase  64.76 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12233  hypothetical protein  56.32 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.194951  normal  0.855541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1529  glycerate kinase  57.88 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107717  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1010  glycerate kinase  45.58 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1660  glycerate kinase  44.64 
 
 		 391 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.162616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4147  glycerate kinase  44.8 
 
 		 372 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.676652  decreased coverage  0.00778507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0956  glycerate kinase  44.89 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.421654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3537  glycerate kinase  43.78 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181581  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  38.85 
 
 		 378 aa  195  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  36.07 
 
 		 379 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  38.56 
 
 		 382 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  36.07 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  35.81 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  36.07 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  39.21 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  38.52 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  37.73 
 
 		 378 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  36.94 
 
 		 378 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  36.22 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  36.68 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3305  glycerate kinase  45.78 
 
 		 378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  35.83 
 
 		 379 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  41.6 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  36.34 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  34.95 
 
 		 373 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  33.16 
 
 		 381 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  36.31 
 
 		 380 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  34.92 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  38.24 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  38.87 
 
 		 381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  37.97 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  34.95 
 
 		 373 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0572  glycerate kinase  39.68 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0411866  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  35.34 
 
 		 392 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  38.73 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  34.66 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0239  Glycerate kinase  39.84 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0123  glycerate kinase  39.73 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1163  glycerate kinase  43.41 
 
 		 359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4863  glycerate kinase GcxK  33.07 
 
 		 380 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432659  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  35.17 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  35.36 
 
 		 380 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1342  glycerate kinase  39.16 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  37.63 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3147  glycerate kinase  46.09 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  35.09 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  34.65 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4821  glycerate kinase  42.48 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  35.09 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  34.65 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  31.75 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  32.28 
 
 		 381 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  34.74 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12960  glycerate kinase  39.34 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  35.09 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  32.28 
 
 		 381 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  34.1 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  32.28 
 
 		 381 aa  169  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  32.28 
 
 		 381 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  36.32 
 
 		 384 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  35.09 
 
 		 380 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  32.28 
 
 		 381 aa  169  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  32.28 
 
 		 408 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  36.36 
 
 		 375 aa  169  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  31.75 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  32.28 
 
 		 408 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  32.28 
 
 		 381 aa  169  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  35.64 
 
 		 380 aa  169  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2233  glycerate kinase  34.65 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  34.46 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  31.85 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  37.08 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  39.63 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  39.63 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  39.36 
 
 		 394 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  37.8 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  34.91 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  39.36 
 
 		 388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  31.75 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  37.67 
 
 		 379 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  35.81 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  38.98 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  39.81 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  34.02 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1024  glycerate kinase  39.46 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  35.81 
 
 		 381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  38.44 
 
 		 381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  31.66 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  39.26 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  37 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  38.44 
 
 		 381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  40.72 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  40.72 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  34.4 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  33.86 
 
 		 384 aa  162  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  34.58 
 
 		 381 aa  162  8.000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  29.76 
 
 		 384 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  40 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>