212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12233 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12233  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  736    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.194951  normal  0.855541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3569  glycerate kinase  68.77 
 
 		 353 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.581424  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2944  glycerate kinase  67.43 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3065  glycerate kinase  56.32 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.831478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1529  glycerate kinase  53.18 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107717  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0956  glycerate kinase  43.09 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.421654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1660  glycerate kinase  41.6 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.162616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  39.52 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  41.76 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1010  glycerate kinase  44.54 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0123  glycerate kinase  41.94 
 
 		 374 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0239  Glycerate kinase  42.2 
 
 		 374 aa  186  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  36.24 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  36.24 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  36.24 
 
 		 408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  36.24 
 
 		 408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  36.24 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  36.24 
 
 		 381 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  36.24 
 
 		 381 aa  182  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  36.24 
 
 		 381 aa  182  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  39.28 
 
 		 380 aa  179  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  35.2 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  36.91 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  35.73 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  38.44 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  41.19 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  34.74 
 
 		 378 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3537  glycerate kinase  41.19 
 
 		 386 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181581  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  40.05 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  36.53 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  34.47 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  34.32 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  35.2 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4147  glycerate kinase  40.32 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.676652  decreased coverage  0.00778507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  39.12 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  35.92 
 
 		 381 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  34.47 
 
 		 378 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3130  glycerate kinase  40.11 
 
 		 377 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00415476  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  37.14 
 
 		 380 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  37.63 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  39.41 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  37.87 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  35.39 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  35.43 
 
 		 378 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  35.47 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  35.66 
 
 		 381 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  35.39 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  35.39 
 
 		 381 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  35.66 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  35.73 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3305  glycerate kinase  40.28 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  33.6 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  33.62 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  36.51 
 
 		 389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14280  glycerate kinase  38.52 
 
 		 396 aa  166  8e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000570843  normal  0.0813973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  35.47 
 
 		 380 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  35.86 
 
 		 384 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  35.2 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  36.27 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  35.2 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  35.37 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  35.37 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  34.41 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5723  glycerate kinase  40.61 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  35.37 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4863  glycerate kinase GcxK  35.03 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432659  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  34.92 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  37.1 
 
 		 379 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  34.4 
 
 		 378 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  35.12 
 
 		 379 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  34.91 
 
 		 392 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0185  glycerate kinase  36.02 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  31.9 
 
 		 379 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  34.95 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2549  glycerate kinase  40.37 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  34.66 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  34.66 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  33.95 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12960  glycerate kinase  40 
 
 		 375 aa  159  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  37.63 
 
 		 379 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  35.47 
 
 		 380 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1024  glycerate kinase  35 
 
 		 378 aa  159  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  32.8 
 
 		 380 aa  156  6e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  34.21 
 
 		 381 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  37.07 
 
 		 378 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  33.69 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  33.69 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  37.01 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  37.6 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  32.24 
 
 		 386 aa  154  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1342  glycerate kinase  35.98 
 
 		 378 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3439  Glycerate kinase  35.97 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3147  glycerate kinase  42.54 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  36.41 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1372  glycerate kinase  34.04 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125606 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  36.15 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  37.2 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  31.99 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  37.9 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1926  glycerate kinase  36.14 
 
 		 371 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>