216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1660 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1660  glycerate kinase  100 
 
 		 391 aa  751    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.162616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1010  glycerate kinase  54.03 
 
 		 363 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0956  glycerate kinase  53.21 
 
 		 373 aa  299  7e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.421654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4147  glycerate kinase  49.49 
 
 		 372 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.676652  decreased coverage  0.00778507 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  40.97 
 
 		 377 aa  252  8.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  40.97 
 
 		 381 aa  243  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  40.71 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  42.68 
 
 		 378 aa  239  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3537  glycerate kinase  46.88 
 
 		 386 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181581  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  41.88 
 
 		 379 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  40.61 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  40.61 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  42.09 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  40.36 
 
 		 378 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  40.4 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  36.46 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  43.88 
 
 		 380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  43 
 
 		 381 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  38.36 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  38.99 
 
 		 392 aa  223  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3065  glycerate kinase  45.8 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.831478  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  37.12 
 
 		 379 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  39.45 
 
 		 394 aa  215  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  42.82 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  38.97 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  40.97 
 
 		 379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  37.63 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  37.97 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  37.69 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  40.97 
 
 		 379 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  38.74 
 
 		 380 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  40.45 
 
 		 384 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  37.63 
 
 		 381 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3569  glycerate kinase  46.67 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.581424  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  39.14 
 
 		 384 aa  209  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  40.51 
 
 		 379 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  37.69 
 
 		 373 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  37 
 
 		 381 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  37.22 
 
 		 381 aa  209  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  37.22 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  37.22 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  37.22 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  37.22 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  37.22 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  35.43 
 
 		 385 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  44.16 
 
 		 386 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  37.89 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  36.39 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  36.16 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  36.71 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  36.75 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  40 
 
 		 379 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2944  glycerate kinase  47.04 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  41.88 
 
 		 381 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  39.69 
 
 		 379 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  39.69 
 
 		 379 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  39.69 
 
 		 379 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  35.91 
 
 		 402 aa  205  9e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  36.71 
 
 		 381 aa  205  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  36.09 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  36.09 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  36.32 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  37.91 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  41.18 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  38.19 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  36.6 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  42.57 
 
 		 378 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  39.85 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  39.59 
 
 		 379 aa  203  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  38.1 
 
 		 395 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  41.73 
 
 		 379 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  39.44 
 
 		 379 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3439  Glycerate kinase  40.54 
 
 		 398 aa  202  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  37.5 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  37.63 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3692  glycerate kinase  40.1 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  40.85 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  35.32 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  37.5 
 
 		 380 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  36.78 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  37.5 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  36.2 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  36.25 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  36.25 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  36.25 
 
 		 381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  34.1 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  36.25 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  35.44 
 
 		 387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  36.09 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  37.24 
 
 		 380 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  35.68 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  36.25 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  35.11 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  39.13 
 
 		 389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  37.24 
 
 		 380 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  33.25 
 
 		 384 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  34.31 
 
 		 380 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  35.99 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  39.95 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3147  glycerate kinase  46.68 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>