86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0462 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0462  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 77 aa  156  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0125942  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1528  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  76.12 
 
 		 88 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.546618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0445  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  76.12 
 
 		 81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0391  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  74.24 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.97 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.19687  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.34 
 
 		 432 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.93 
 
 		 306 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1597  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.07 
 
 		 607 aa  47.4  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2129  iron-sulfur cluster binding protein  34.92 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  32.79 
 
 		 316 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  33.33 
 
 		 791 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0057  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  35.82 
 
 		 735 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.9 
 
 		 84 aa  43.9  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000001451 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0032  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.43 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2260  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.43 
 
 		 438 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00125851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.33 
 
 		 502 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3883  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.62 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 371 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00514975  hitchhiker  0.000746109 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.79 
 
 		 438 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1159  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.35 
 
 		 1002 aa  42.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 355 aa  42.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000413474  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1691  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.79 
 
 		 438 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.360384  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.33 
 
 		 301 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08380  2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, gamma subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate family/2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, delta subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate family  33.33 
 
 		 355 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.198369  normal  0.196547 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0528  hypothetical protein  37.93 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.625132 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1238  pyruvate synthase, gamma subunit  36.21 
 
 		 310 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07910  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  40.68 
 
 		 447 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0703  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38 
 
 		 543 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  49.09 
 
 		 596 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  29.41 
 
 		 507 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1072  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.65 
 
 		 233 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0828  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 652 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.74 
 
 		 421 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  36.36 
 
 		 383 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16960  4Fe-4S protein  29.51 
 
 		 398 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2323  electron transport complex protein RnfC  32.5 
 
 		 737 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3521  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.21 
 
 		 66 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  33.82 
 
 		 540 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1589  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  33.33 
 
 		 285 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.78 
 
 		 542 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  39.29 
 
 		 647 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0708  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 393 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  30.36 
 
 		 505 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3090  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.2 
 
 		 545 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.595206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0418  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 1142 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.718645  normal  0.455985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1918  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  34.25 
 
 		 673 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2023  electron transport complex protein RnfC  31.25 
 
 		 747 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2149  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.85 
 
 		 1013 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0251  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.48 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1265  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.755601  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0324  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.84 
 
 		 652 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.574765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0532  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.11 
 
 		 55 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000183692  normal  0.0950225 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  45.1 
 
 		 629 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1963  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  39.22 
 
 		 541 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1168  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  32.73 
 
 		 302 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  30.14 
 
 		 507 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1568  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.09 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3715  glycyl-radical enzyme activating protein family  29.51 
 
 		 316 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2413  quinol dehydrogenase membrane component  31.03 
 
 		 287 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1450  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.94 
 
 		 762 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2717  quinol dehydrogenase membrane component  31.03 
 
 		 287 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1210  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 393 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  35.94 
 
 		 292 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 393 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 351 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1328  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  26.09 
 
 		 1184 aa  40.8  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000692132 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  33.82 
 
 		 506 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.9 
 
 		 62 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112658  normal  0.013412 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1647  heterodisulfide reductase, subunit A  35.19 
 
 		 752 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  27.12 
 
 		 396 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1964  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  31.03 
 
 		 766 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2793  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  40.35 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00379398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0854  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 590 aa  40.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.473687  normal  0.869505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  35.85 
 
 		 634 aa  40.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2358  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.37 
 
 		 544 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 708 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.48 
 
 		 105 aa  40  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.48 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000213739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1431  NIL domain protein  34.38 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000290887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  40.35 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0495  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 394 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0994  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 395 aa  40  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 131 aa  40  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.188784  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0720  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  25.81 
 
 		 681 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>