63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1703 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  248  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  56.82 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  57.95 
 
 
98 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  56.82 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  57.95 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  55.68 
 
 
98 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  56.82 
 
 
98 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  52.27 
 
 
95 aa  101  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  52.27 
 
 
95 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  56.32 
 
 
98 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  52.27 
 
 
95 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  53.41 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  53.93 
 
 
115 aa  95.9  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  51.14 
 
 
96 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  48.86 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  50 
 
 
101 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  49.43 
 
 
96 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  50 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  55.41 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  51.72 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  46.59 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  50.57 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  46.74 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  48.28 
 
 
96 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  55.68 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  42.5 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  44.93 
 
 
99 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  48.48 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  37.97 
 
 
97 aa  67  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  37.8 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  46.75 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  43.84 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  46.75 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  42.62 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  39.29 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  37.5 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  42.31 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  44.12 
 
 
88 aa  60.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  45.31 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  31.17 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  38.18 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  32.93 
 
 
206 aa  53.9  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  38.6 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  32.86 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  35 
 
 
296 aa  47.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1482  protein of unknown function DUF339  39.29 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00599  TPR repeat region superfamily  40 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  33.78 
 
 
175 aa  44.7  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  36.67 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1752  hypothetical protein  37.97 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  0.110939 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0871  hypothetical protein  44.68 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.736883  normal  0.107971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1234  hypothetical protein  33.85 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324963  hitchhiker  0.00019787 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  34.38 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  34.38 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  34.38 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  35 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  38.78 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  38.78 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1045  hypothetical protein  32.31 
 
 
83 aa  40.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.453082  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  31.75 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2360  protein of unknown function DUF339  37.31 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>