38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_43817 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  100 
 
 
206 aa  423  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  38.89 
 
 
95 aa  60.1  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  38.89 
 
 
95 aa  60.1  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  38.67 
 
 
95 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  33.72 
 
 
98 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  33.72 
 
 
98 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  30.59 
 
 
96 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  31.46 
 
 
92 aa  54.3  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  40.3 
 
 
101 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  34.12 
 
 
96 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
98 aa  53.5  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  32.93 
 
 
120 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  31.43 
 
 
82 aa  53.9  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  34.72 
 
 
101 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  31.4 
 
 
98 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  33.78 
 
 
93 aa  53.1  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  30.77 
 
 
98 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  31.4 
 
 
98 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  31.76 
 
 
96 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  36.25 
 
 
98 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  33.73 
 
 
175 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  30.77 
 
 
98 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  36.62 
 
 
103 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  34.72 
 
 
101 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  29.89 
 
 
122 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  35.94 
 
 
149 aa  49.7  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  34.62 
 
 
97 aa  50.1  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  32.88 
 
 
88 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  26.74 
 
 
103 aa  48.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  36.67 
 
 
96 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  29.87 
 
 
97 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  28.83 
 
 
296 aa  46.2  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  30.56 
 
 
98 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  34.92 
 
 
99 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  31.94 
 
 
97 aa  41.6  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>