43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53561 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  100 
 
 		 149 aa  298  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  49.06 
 
 		 175 aa  103  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  38.13 
 
 		 296 aa  99.4  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  38.46 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  40.54 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  36.84 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  40.32 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  37.18 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  33.72 
 
 		 103 aa  52  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  39.47 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  34.94 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  32.05 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  32.61 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  42.62 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  30.14 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  32.86 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  30.43 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  30.14 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  31.43 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  30.11 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  31.88 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  31.58 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  36.76 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  34.21 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  32.93 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  29.63 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  30.99 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  34.85 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  46.43 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  32.89 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  30.14 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  27.17 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  32.56 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  26.67 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  32 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  38.89 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  37.04 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  36.23 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  30.36 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  35.19 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>