60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6309 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  200  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  93.88 
 
 		 98 aa  191  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  80.61 
 
 		 98 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  79.59 
 
 		 98 aa  168  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  78.57 
 
 		 98 aa  167  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  75.51 
 
 		 98 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  50.52 
 
 		 98 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  60.64 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  56.25 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  58.06 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  56.84 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  59.14 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  59.55 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  58.43 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  51.69 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  51.69 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  52.08 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  56.18 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  52.81 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  55.56 
 
 		 101 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  55.68 
 
 		 120 aa  107  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  57.14 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  47.96 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  57.45 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  48.24 
 
 		 101 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  44.58 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  46.25 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  42.86 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  44.05 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  35.37 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  47.89 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  41.1 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  33.77 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  39.44 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  39.44 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  42.47 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  43.08 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  27.38 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  30.99 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  37.18 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  39.71 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  35.53 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  30.77 
 
 		 206 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  39.68 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1752  hypothetical protein  30.95 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  0.110939 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  30.38 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  31.88 
 
 		 296 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1539  protein of unknown function DUF339  35.48 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183643  normal  0.747807 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  36.51 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  36.51 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2938  hypothetical protein  28.12 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1028  hypothetical protein  28.12 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0859  hypothetical protein  34.38 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  41.3 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002489  hypothetical protein  34.48 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.864152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2254  response regulator receiver domain-containing protein  39.62 
 
 		 81 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00897791  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3305  hypothetical protein  30.14 
 
 		 88 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2775  hypothetical protein  32.08 
 
 		 82 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>