50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2937 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  100 
 
 		 96 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  92.47 
 
 		 96 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  89.58 
 
 		 96 aa  176  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  80.65 
 
 		 96 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  69.66 
 
 		 96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  64.21 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  73.4 
 
 		 95 aa  120  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  62.77 
 
 		 98 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  60.64 
 
 		 98 aa  117  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  53.12 
 
 		 98 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  56.18 
 
 		 101 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  53.12 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  52.08 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  55.06 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  52.08 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  51.52 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  58.43 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  55.06 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  49.44 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  49.44 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  48.31 
 
 		 95 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  46.07 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  47.31 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  51.72 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  43.82 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  46.05 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  39.76 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  42.35 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  39.73 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  43.42 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  39.73 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  41.56 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  44 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  43.84 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  42.68 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  32 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  43.84 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  43.84 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  42.25 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  34.78 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  37.5 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  38.16 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  43.94 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  30.86 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  31.76 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  31.33 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  34.21 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  42.62 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  39.22 
 
 		 296 aa  45.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  41.27 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>