57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2054 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  193  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  84.38 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  69.66 
 
 		 96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  72.83 
 
 		 95 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  65.59 
 
 		 96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  67.42 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  66.29 
 
 		 96 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  59.14 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  59.14 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  57.3 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  55.06 
 
 		 98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  56.18 
 
 		 98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  53.68 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  55.06 
 
 		 98 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  53.33 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  52.22 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  52.22 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  51.11 
 
 		 95 aa  95.9  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  51.11 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  45.56 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  46.07 
 
 		 101 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  51.14 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  46.24 
 
 		 98 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  55 
 
 		 101 aa  88.6  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  47.19 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  38.82 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  42.35 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  39.76 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  40.51 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  45.21 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  34.67 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  36.9 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  35.8 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  40.26 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  39.73 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  31.88 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  40.32 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  36 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  45.9 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  43.94 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  45.9 
 
 		 79 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  37.04 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  37.18 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  36.67 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  33.78 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  38.75 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  30.99 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  38.81 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  35.29 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1336  hypothetical protein  43.4 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.401477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  37.93 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2861  hypothetical protein  31.51 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  32.14 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  32.14 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  32.14 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>