59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2861 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2861  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  157  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  36.71 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  36.71 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  36.71 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  37.14 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  35.62 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2360  protein of unknown function DUF339  40 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03545  hypothetical protein  37.14 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1482  protein of unknown function DUF339  42.47 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  35.71 
 
 
86 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0871  hypothetical protein  33.8 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.736883  normal  0.107971 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002489  hypothetical protein  34.29 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.864152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2469  hypothetical protein  38.75 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.917768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3305  hypothetical protein  36.62 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1339  hypothetical protein  32.05 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3430  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3035  hypothetical protein  31.08 
 
 
79 aa  48.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.380295 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0852  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3317  hypothetical protein  32.05 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3030  hypothetical protein  32.05 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0812  hypothetical protein  32.05 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.463653  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4188  hypothetical protein  32.05 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3223  hypothetical protein  32.05 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02692  hypothetical protein  32.05 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.213923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0795  protein of unknown function DUF339  32.05 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02729  hypothetical protein  32.05 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1150  hypothetical protein  31.08 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2775  hypothetical protein  33.33 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  32.5 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3384  hypothetical protein  32.05 
 
 
88 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3204  hypothetical protein  32.05 
 
 
88 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3216  hypothetical protein  32.05 
 
 
88 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3279  hypothetical protein  32.05 
 
 
88 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3282  hypothetical protein  32.05 
 
 
88 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0638  hypothetical protein  32.05 
 
 
88 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3315  hypothetical protein  30.77 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  29.33 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2857  hypothetical protein  29.73 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2939  hypothetical protein  29.73 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.427354  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1336  hypothetical protein  41.1 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.401477  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1541  hypothetical protein  39.34 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4131  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  32.5 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3898  hypothetical protein  32.05 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.929293  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00599  TPR repeat region superfamily  33.77 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1539  protein of unknown function DUF339  32.39 
 
 
82 aa  43.5  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183643  normal  0.747807 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0063  hypothetical protein  32.05 
 
 
83 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.848374 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2254  response regulator receiver domain-containing protein  35.62 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00897791  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1095  hypothetical protein  32.88 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0188486 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1186  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.990157  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1876  protein of unknown function DUF339  36.76 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157689  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4387  hypothetical protein  29.87 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121932  normal  0.80416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1424  hypothetical protein  29.87 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.831953  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0042  hypothetical protein  39.34 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4297  hypothetical protein  29.87 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.872418  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  31.51 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1604  hypothetical protein  30 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1358  hypothetical protein  29.87 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476265  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>