99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2469 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2469  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  168  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.917768  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2938  hypothetical protein  48.05 
 
 
83 aa  77  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1045  hypothetical protein  44.16 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.453082  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00599  TPR repeat region superfamily  45.33 
 
 
82 aa  70.1  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2857  hypothetical protein  44.16 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2939  hypothetical protein  44.16 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.427354  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0871  hypothetical protein  43.84 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.736883  normal  0.107971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1339  hypothetical protein  41.98 
 
 
82 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2775  hypothetical protein  41.98 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1269  hypothetical protein  41.56 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3121  protein of unknown function DUF339  41.56 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0704763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1139  hypothetical protein  42.86 
 
 
83 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384538  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1028  hypothetical protein  42.47 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1192  hypothetical protein  42.47 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1236  hypothetical protein  42.47 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1150  hypothetical protein  42.86 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225025  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3035  hypothetical protein  41.56 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.380295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1234  hypothetical protein  41.1 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324963  hitchhiker  0.00019787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2861  hypothetical protein  38.75 
 
 
80 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3282  hypothetical protein  40.26 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  37.66 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  36.36 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3279  hypothetical protein  40.26 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3216  hypothetical protein  40.26 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0063  hypothetical protein  40.85 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.848374 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3204  hypothetical protein  40.26 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3384  hypothetical protein  40.26 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1539  protein of unknown function DUF339  42.25 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183643  normal  0.747807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1482  protein of unknown function DUF339  40.79 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  35.53 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03545  hypothetical protein  36 
 
 
86 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  36.23 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002489  hypothetical protein  34.62 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.864152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  38.36 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4188  hypothetical protein  37.66 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0812  hypothetical protein  37.66 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.463653  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3030  hypothetical protein  37.66 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0795  protein of unknown function DUF339  37.66 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02692  hypothetical protein  37.66 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.213923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3223  hypothetical protein  37.66 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3317  hypothetical protein  37.66 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4131  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02729  hypothetical protein  37.66 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166664  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1876  protein of unknown function DUF339  42.42 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157689  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  37.14 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  37.14 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  37.14 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1336  hypothetical protein  38.89 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.401477  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3430  hypothetical protein  32.47 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0638  hypothetical protein  35.71 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3315  hypothetical protein  43.4 
 
 
88 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3305  hypothetical protein  34.29 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1604  hypothetical protein  32.47 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1095  hypothetical protein  38.89 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0188486 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0852  hypothetical protein  35.71 
 
 
88 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1541  hypothetical protein  43.33 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03010  TPR repeat protein  41.67 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00895088  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0346  hypothetical protein  36.11 
 
 
82 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0382  hypothetical protein  36.11 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2254  response regulator receiver domain-containing protein  31.94 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00897791  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2360  protein of unknown function DUF339  37.5 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  34.72 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  39.06 
 
 
120 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  36.76 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1186  hypothetical protein  42.25 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.990157  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2265  hypothetical protein  35.21 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13630  hypothetical protein  34.72 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3898  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.929293  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  32.39 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2151  hypothetical protein  34.72 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.164508  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  32.88 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  33.8 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0537  hypothetical protein  28.17 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000909772  unclonable  0.000000000852807 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  32.86 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  33.82 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  30.88 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1426  protein of unknown function DUF339  42.22 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  31.75 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  32.26 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  32.35 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  31.75 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  30.99 
 
 
96 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  38.98 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  33.33 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  31.75 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  32.88 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1064  hypothetical protein  28.95 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410719  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1424  hypothetical protein  28.95 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.831953  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4387  hypothetical protein  28.95 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121932  normal  0.80416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4297  hypothetical protein  28.95 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.872418  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2018  hypothetical protein  30 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.266324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  39.66 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1464  hypothetical protein  35.59 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00913316  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  35.59 
 
 
115 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1358  hypothetical protein  28.95 
 
 
84 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476265  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1736  hypothetical protein  30 
 
 
93 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.338118  normal  0.132822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>