56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2618 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  200  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  51.04 
 
 
97 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  51.25 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  50 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  45.57 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  45.88 
 
 
98 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  48.78 
 
 
98 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  50 
 
 
98 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  48.78 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  46.34 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  47.56 
 
 
98 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  43.33 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  48.78 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  45.57 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  45.57 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  45.78 
 
 
95 aa  77  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  43.04 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  43.59 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  42.31 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  41.77 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  47.83 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  42.35 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  39.76 
 
 
88 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  44.16 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  42.35 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  42.17 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  45.59 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  41.46 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  41.56 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  42.31 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  40.58 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  43.04 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  40.58 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  42.19 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  31.25 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  37.5 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  41.77 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  32.39 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
98 aa  58.9  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  38.75 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  37.33 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  31.08 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  44.3 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  32.86 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0871  hypothetical protein  31.82 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.736883  normal  0.107971 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  33.33 
 
 
296 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2938  hypothetical protein  30.3 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  35.94 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  35.94 
 
 
79 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1028  hypothetical protein  35.48 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  33.73 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1045  hypothetical protein  30.3 
 
 
83 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.453082  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  32 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  31.94 
 
 
206 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1139  hypothetical protein  32.73 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384538  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1339  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>