49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2621 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  94.57 
 
 		 96 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  92.47 
 
 		 96 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  81.25 
 
 		 96 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  67.42 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  62.92 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  62.92 
 
 		 98 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  69.47 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  58.43 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  60.47 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  55.06 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  53.93 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  55.06 
 
 		 98 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  51.61 
 
 		 98 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  51.61 
 
 		 98 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  56.18 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  50.54 
 
 		 98 aa  103  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  50.54 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  48.91 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  48.91 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  47.83 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  46.07 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  50.57 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  41.57 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  41.77 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  43.42 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  42.17 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  39.73 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  44.74 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  38.64 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  45.21 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  43.9 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  41.33 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  32 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  34.78 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  41.1 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  38.16 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  32.1 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  41.1 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  34.12 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  39.44 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  34.72 
 
 		 93 aa  52.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  40.91 
 
 		 86 aa  50.8  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  32.89 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  28.75 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  39.22 
 
 		 296 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  39.34 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>