58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0761 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  176  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  98.88 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  91.01 
 
 		 89 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  58.54 
 
 		 99 aa  104  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  52.56 
 
 		 92 aa  88.2  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  57.5 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  43.82 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  40.58 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  46.75 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  40 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  42.31 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  40.28 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  41.54 
 
 		 86 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  41.03 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  38.27 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  35.82 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  39.44 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  37.04 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  37.5 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  37.04 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  38.75 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  37.5 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  40.91 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  43.84 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  34.18 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  35.9 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  32.18 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  48.72 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  41.1 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  41.54 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  38.46 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  35.82 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  37.84 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  35.82 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  40.58 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  33.85 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  37.04 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  32.86 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  33.78 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  39.06 
 
 		 296 aa  47  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2254  response regulator receiver domain-containing protein  43.4 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00897791  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  33.78 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  36.67 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  31.34 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0871  hypothetical protein  31.75 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.736883  normal  0.107971 
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  27.03 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  33.8 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2027  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4760  hypothetical protein  36.92 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  31.51 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54470  hypothetical protein  36.92 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234061  normal  0.929055 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00599  TPR repeat region superfamily  35.44 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  36.73 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002489  hypothetical protein  32.14 
 
 		 86 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.864152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>