60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1514 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  84.38 
 
 		 96 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  64.21 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  66.29 
 
 		 96 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  62.92 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  70 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  60.67 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  56.04 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  57.14 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  54.95 
 
 		 98 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  53.85 
 
 		 98 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  53.85 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  51.65 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  48.89 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  48.89 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  48.89 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  48.89 
 
 		 115 aa  93.2  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  48.89 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  43.82 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  43.33 
 
 		 101 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  45.56 
 
 		 98 aa  88.6  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  46.59 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  47.06 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  41.3 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  34.52 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  40.26 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  41.77 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  60.1  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  42.03 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  52.54 
 
 		 79 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  35.87 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  52.54 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  39.29 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  44.3 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  35.06 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  34.94 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  29.33 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  35.53 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  44.78 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  39.29 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  29.89 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  33.78 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  36.76 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  38.1 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  30 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  38.67 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  40.74 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  36.26 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002489  hypothetical protein  29.73 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.864152  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  28.4 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  37.88 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  37.88 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  37.88 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03545  hypothetical protein  35.19 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1336  hypothetical protein  36.36 
 
 		 76 aa  40  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.401477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>