58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0937 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  163  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  58.75 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  57.5 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  57.5 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  51.39 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  50.65 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  43.66 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  47.3 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  44 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  41.25 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  43.24 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  44.74 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  40.54 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  56.86 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  51.92 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  42.47 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  42.47 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  45.31 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  41.1 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  41.33 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  38.67 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  38.75 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  42.47 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  49.02 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  42.86 
 
 		 96 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  39.19 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  36.49 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  44.3 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  31.51 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  39.73 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  42 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  36.84 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  42.37 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  36.11 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  41.18 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  33.82 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  38.81 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  42.37 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  42 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  39.22 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  39.22 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1064  hypothetical protein  40.3 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  45.45 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4297  hypothetical protein  38.24 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.872418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1424  hypothetical protein  38.24 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.831953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4387  hypothetical protein  38.24 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121932  normal  0.80416 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  46.43 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  39.66 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3961  hypothetical protein  38.81 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312383  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4227  hypothetical protein  38.81 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2254  response regulator receiver domain-containing protein  37.68 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00897791  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  32.39 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1358  hypothetical protein  38.81 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  33.96 
 
 		 88 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2151  hypothetical protein  41.67 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.164508  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  39.22 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>