79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4227 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4227  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3961  hypothetical protein  98.81 
 
 		 84 aa  168  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1358  hypothetical protein  85.71 
 
 		 84 aa  147  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1424  hypothetical protein  82.14 
 
 		 84 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.831953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4297  hypothetical protein  82.14 
 
 		 84 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.872418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4387  hypothetical protein  82.14 
 
 		 84 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121932  normal  0.80416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1064  hypothetical protein  80.95 
 
 		 84 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1464  hypothetical protein  79.76 
 
 		 84 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00913316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54470  hypothetical protein  75.9 
 
 		 84 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234061  normal  0.929055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4760  hypothetical protein  75.9 
 
 		 84 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13630  hypothetical protein  71.43 
 
 		 84 aa  127  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2265  hypothetical protein  63.29 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2151  hypothetical protein  51.22 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.164508  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0063  hypothetical protein  48.78 
 
 		 83 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.848374 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3035  hypothetical protein  50.63 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.380295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1150  hypothetical protein  48.1 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4131  TPR repeat-containing protein  52.7 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1095  hypothetical protein  51.85 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2857  hypothetical protein  50.65 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2939  hypothetical protein  50.65 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.427354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2254  response regulator receiver domain-containing protein  46.75 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00897791  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1339  hypothetical protein  48.78 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3121  protein of unknown function DUF339  46.34 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0704763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1269  hypothetical protein  46.34 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1236  hypothetical protein  48.05 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1192  hypothetical protein  48.05 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2775  hypothetical protein  46.34 
 
 		 82 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0852  hypothetical protein  45.21 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1139  hypothetical protein  43.37 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0871  hypothetical protein  46.67 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.736883  normal  0.107971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1045  hypothetical protein  43.37 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.453082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2938  hypothetical protein  40.96 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3305  hypothetical protein  45.83 
 
 		 88 aa  72  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3898  hypothetical protein  47.22 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.929293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  41.89 
 
 		 83 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  40.79 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  40.79 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  40.79 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0812  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.463653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3030  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3317  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4188  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02692  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.213923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0795  protein of unknown function DUF339  44.44 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3223  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02729  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166664  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0638  hypothetical protein  42.47 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3315  hypothetical protein  45.83 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1604  hypothetical protein  43.48 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3430  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3384  hypothetical protein  43.06 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3204  hypothetical protein  43.06 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3216  hypothetical protein  43.06 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3279  hypothetical protein  43.06 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3282  hypothetical protein  43.06 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1028  hypothetical protein  40.79 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1234  hypothetical protein  44.59 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324963  hitchhiker  0.00019787 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03010  TPR repeat protein  46.15 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00895088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03545  hypothetical protein  41.1 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002489  hypothetical protein  39.73 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.864152  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  34.18 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0346  hypothetical protein  33.78 
 
 		 82 aa  52.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0382  hypothetical protein  32.43 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  31.17 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1336  hypothetical protein  36.62 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.401477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0537  hypothetical protein  31.88 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000909772  unclonable  0.000000000852807 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00599  TPR repeat region superfamily  38.33 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2018  hypothetical protein  29.17 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.266324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1482  protein of unknown function DUF339  38.67 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1736  hypothetical protein  29.17 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.338118  normal  0.132822 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  36.84 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1539  protein of unknown function DUF339  34.62 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183643  normal  0.747807 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  38.81 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2360  protein of unknown function DUF339  32 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1876  protein of unknown function DUF339  37.31 
 
 		 84 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1541  hypothetical protein  36.67 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>