98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3159 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  176  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0063  hypothetical protein  59.21 
 
 		 83 aa  103  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.848374 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4131  TPR repeat-containing protein  56.25 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2857  hypothetical protein  55.41 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2939  hypothetical protein  55.41 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.427354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002489  hypothetical protein  53.49 
 
 		 86 aa  97.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.864152  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  52.33 
 
 		 86 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1339  hypothetical protein  54.79 
 
 		 82 aa  97.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2775  hypothetical protein  55.41 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03545  hypothetical protein  52.33 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3035  hypothetical protein  54.05 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.380295 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  51.9 
 
 		 86 aa  94  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1150  hypothetical protein  54.05 
 
 		 79 aa  93.6  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225025  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1028  hypothetical protein  52 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1192  hypothetical protein  50.68 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1269  hypothetical protein  50.68 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1045  hypothetical protein  49.38 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.453082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1236  hypothetical protein  50.68 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3121  protein of unknown function DUF339  50.68 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0704763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1139  hypothetical protein  48.15 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2938  hypothetical protein  46.91 
 
 		 83 aa  88.6  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1234  hypothetical protein  50.68 
 
 		 83 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324963  hitchhiker  0.00019787 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0871  hypothetical protein  49.32 
 
 		 79 aa  87.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.736883  normal  0.107971 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03010  TPR repeat protein  54.55 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00895088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3305  hypothetical protein  52 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3430  hypothetical protein  52 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0638  hypothetical protein  49.33 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2265  hypothetical protein  44.74 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3898  hypothetical protein  48 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.929293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0852  hypothetical protein  48 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1064  hypothetical protein  41.46 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  47.37 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  47.37 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  47.37 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1358  hypothetical protein  40.24 
 
 		 84 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13630  hypothetical protein  44.59 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3315  hypothetical protein  47.95 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3223  hypothetical protein  47.95 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0795  protein of unknown function DUF339  47.95 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4188  hypothetical protein  47.95 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02692  hypothetical protein  47.95 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.213923  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3216  hypothetical protein  46.58 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3384  hypothetical protein  46.58 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0812  hypothetical protein  47.95 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.463653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3204  hypothetical protein  46.58 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3030  hypothetical protein  47.95 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3317  hypothetical protein  47.95 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3282  hypothetical protein  46.58 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3279  hypothetical protein  46.58 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02729  hypothetical protein  47.95 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1095  hypothetical protein  46.05 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4297  hypothetical protein  39.02 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.872418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1424  hypothetical protein  39.02 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.831953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4387  hypothetical protein  39.02 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121932  normal  0.80416 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3961  hypothetical protein  41.89 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312383  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4227  hypothetical protein  41.89 
 
 		 84 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  44.93 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  44.93 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1464  hypothetical protein  40.24 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00913316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4760  hypothetical protein  40.24 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54470  hypothetical protein  40.24 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234061  normal  0.929055 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1604  hypothetical protein  38.67 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  51.79 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  51.79 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2254  response regulator receiver domain-containing protein  38.67 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00897791  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2151  hypothetical protein  38.57 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.164508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1336  hypothetical protein  39.13 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.401477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00599  TPR repeat region superfamily  36.36 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0346  hypothetical protein  37.88 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1482  protein of unknown function DUF339  39.13 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0382  hypothetical protein  36.36 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1539  protein of unknown function DUF339  35.21 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183643  normal  0.747807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2546  protein of unknown function DUF339  41.79 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.930387  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  38.81 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1876  protein of unknown function DUF339  35.82 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2861  hypothetical protein  29.33 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2469  hypothetical protein  35.53 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.917768  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  38.46 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2360  protein of unknown function DUF339  31.08 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1541  hypothetical protein  36.07 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  40 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  38.67 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0537  hypothetical protein  30.3 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000909772  unclonable  0.000000000852807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  38.81 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  38.18 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  35.19 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  28.79 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  38.46 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2018  hypothetical protein  38.3 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.266324 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1736  hypothetical protein  38.3 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.338118  normal  0.132822 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1059  protein of unknown function DUF339  38.6 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.621454  normal  0.0453612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  34.25 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  32.31 
 
 		 91 aa  40.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  36.73 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  36.73 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  31.75 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  38.6 
 
 		 101 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>