68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2546 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2546  protein of unknown function DUF339  100 
 
 
78 aa  156  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.930387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0871  hypothetical protein  39.19 
 
 
79 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.736883  normal  0.107971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  41.79 
 
 
83 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1045  hypothetical protein  38.67 
 
 
83 aa  67  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.453082  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  43.48 
 
 
86 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2938  hypothetical protein  37.84 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3035  hypothetical protein  40.54 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.380295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2939  hypothetical protein  39.19 
 
 
79 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.427354  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2857  hypothetical protein  39.19 
 
 
79 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1150  hypothetical protein  39.19 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225025  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002489  hypothetical protein  41.94 
 
 
86 aa  61.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.864152  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1028  hypothetical protein  36.62 
 
 
79 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03545  hypothetical protein  41.18 
 
 
86 aa  60.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  38.36 
 
 
79 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1269  hypothetical protein  35.14 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3121  protein of unknown function DUF339  35.14 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0704763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1192  hypothetical protein  35.14 
 
 
79 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1236  hypothetical protein  35.14 
 
 
79 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2775  hypothetical protein  37.84 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  36.99 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4131  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1234  hypothetical protein  33.8 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324963  hitchhiker  0.00019787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1339  hypothetical protein  35.14 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0063  hypothetical protein  32.43 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.848374 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1139  hypothetical protein  35.82 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384538  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3305  hypothetical protein  34.25 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2861  hypothetical protein  38.36 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2360  protein of unknown function DUF339  38.33 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3430  hypothetical protein  34.25 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  31.51 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  31.51 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  31.51 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  36.76 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0795  protein of unknown function DUF339  32.88 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3317  hypothetical protein  32.88 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4188  hypothetical protein  32.88 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3030  hypothetical protein  32.88 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0812  hypothetical protein  32.88 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.463653  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02692  hypothetical protein  32.88 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.213923  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02729  hypothetical protein  32.88 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3223  hypothetical protein  32.88 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  33.8 
 
 
82 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 
82 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0638  hypothetical protein  32.88 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0852  hypothetical protein  34.25 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3898  hypothetical protein  32.88 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.929293  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1604  hypothetical protein  30.67 
 
 
84 aa  50.4  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3204  hypothetical protein  30.14 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3384  hypothetical protein  30.14 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3216  hypothetical protein  30.14 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3282  hypothetical protein  30.14 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3279  hypothetical protein  30.14 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03010  TPR repeat protein  33.33 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00895088  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3315  hypothetical protein  31.51 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00599  TPR repeat region superfamily  37.29 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1336  hypothetical protein  43.14 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.401477  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1539  protein of unknown function DUF339  35.59 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183643  normal  0.747807 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  35.14 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1426  protein of unknown function DUF339  44.74 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  30.26 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  31.75 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2254  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
81 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00897791  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  38.3 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0346  hypothetical protein  26.76 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  32.79 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0382  hypothetical protein  26.76 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13630  hypothetical protein  26.03 
 
 
84 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1095  hypothetical protein  25.68 
 
 
91 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0188486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>