76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2360 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2360  protein of unknown function DUF339  100 
 
 		 82 aa  163  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2861  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  48.98 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  46.94 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1234  hypothetical protein  45.1 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324963  hitchhiker  0.00019787 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0871  hypothetical protein  48.98 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.736883  normal  0.107971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4131  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002489  hypothetical protein  35.82 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.864152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  37.7 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1139  hypothetical protein  46 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03545  hypothetical protein  41.07 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1482  protein of unknown function DUF339  45.28 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0063  hypothetical protein  46.94 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.848374 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  36.51 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  44.23 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1426  protein of unknown function DUF339  46.15 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1045  hypothetical protein  43.14 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.453082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1876  protein of unknown function DUF339  40 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2254  response regulator receiver domain-containing protein  44.23 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00897791  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1541  hypothetical protein  42.86 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13630  hypothetical protein  37.5 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1095  hypothetical protein  41.94 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188486 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  31.08 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2938  hypothetical protein  41.18 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2546  protein of unknown function DUF339  64.29 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.930387  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1604  hypothetical protein  36.36 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2775  hypothetical protein  43.14 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1150  hypothetical protein  36.23 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1269  hypothetical protein  34.78 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1236  hypothetical protein  34.78 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3430  hypothetical protein  42 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1192  hypothetical protein  34.78 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1064  hypothetical protein  32 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3121  protein of unknown function DUF339  34.78 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0704763 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  39.62 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4387  hypothetical protein  32 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121932  normal  0.80416 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  39.62 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0638  hypothetical protein  39.62 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1028  hypothetical protein  38 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1336  hypothetical protein  35.21 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.401477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1424  hypothetical protein  32 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.831953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  39.62 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3035  hypothetical protein  36.23 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.380295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4297  hypothetical protein  32 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.872418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2857  hypothetical protein  36.23 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2939  hypothetical protein  36.23 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.427354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4227  hypothetical protein  32 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1797  hypothetical protein  38.18 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.908187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3961  hypothetical protein  32 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1464  hypothetical protein  29.33 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00913316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2702  hypothetical protein  43.18 
 
 		 91 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00765809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54470  hypothetical protein  39.62 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234061  normal  0.929055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4760  hypothetical protein  39.62 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3282  hypothetical protein  33.82 
 
 		 88 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3279  hypothetical protein  33.82 
 
 		 88 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3216  hypothetical protein  33.82 
 
 		 88 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3204  hypothetical protein  33.82 
 
 		 88 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3384  hypothetical protein  33.82 
 
 		 88 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  36.76 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3305  hypothetical protein  31.43 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02692  hypothetical protein  33.82 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.213923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0795  protein of unknown function DUF339  33.82 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02729  hypothetical protein  33.82 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4188  hypothetical protein  33.82 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3317  hypothetical protein  33.82 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3030  hypothetical protein  33.82 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0812  hypothetical protein  33.82 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.463653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3223  hypothetical protein  33.82 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1339  hypothetical protein  41.18 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0852  hypothetical protein  39.62 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  32.26 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1539  protein of unknown function DUF339  39.29 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183643  normal  0.747807 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1059  protein of unknown function DUF339  27.14 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.621454  normal  0.0453612 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1186  hypothetical protein  36.76 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.990157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  37.31 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>