51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1059 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1059  protein of unknown function DUF339  100 
 
 		 89 aa  172  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.621454  normal  0.0453612 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0762  hypothetical protein  89.89 
 
 		 89 aa  157  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2147  protein of unknown function DUF339  50.75 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1823  protein of unknown function DUF339  50.75 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0813209  normal  0.601393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1992  hypothetical protein  49.25 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2423  hypothetical protein  44.3 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2321  hypothetical protein  47.76 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2482  hypothetical protein  47.76 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1797  hypothetical protein  50.88 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.908187  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5590  hypothetical protein  49.25 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.678134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4365  hypothetical protein  49.25 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2148  hypothetical protein  46.27 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3315  hypothetical protein  46.27 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83082  normal  0.599148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3831  hypothetical protein  46.27 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.539928 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0664  TPR repeat-containing protein  58 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2330  TPR repeat-containing protein  58 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2468  TPR repeat-containing protein  58 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113505  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4644  hypothetical protein  44.78 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0789  TPR repeat-containing protein  58 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0308696  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3590  hypothetical protein  44.78 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.068021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3938  hypothetical protein  44.78 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4429  hypothetical protein  44.78 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.731953  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2891  hypothetical protein  58 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6852  protein of unknown function DUF339  58 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.493884 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1745  hypothetical protein  56 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565247  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0503  TPR repeat-containing protein  56 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245858  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1833  hypothetical protein  56 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0385386  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1625  hypothetical protein  56 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0433858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2797  hypothetical protein  45.78 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2265  hypothetical protein  37.1 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0871  hypothetical protein  36.67 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.736883  normal  0.107971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13630  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1234  hypothetical protein  33.9 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324963  hitchhiker  0.00019787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1236  hypothetical protein  35.09 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3121  protein of unknown function DUF339  36.36 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0704763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1269  hypothetical protein  36.36 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1192  hypothetical protein  35.09 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1876  protein of unknown function DUF339  37.93 
 
 		 84 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2287  protein of unknown function DUF339  44.58 
 
 		 90 aa  42.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1028  hypothetical protein  32.35 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1045  hypothetical protein  35.59 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.453082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1139  hypothetical protein  33.9 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  27.85 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1426  protein of unknown function DUF339  58.06 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  38.6 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3604  hypothetical protein  48.72 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002489  hypothetical protein  35.09 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.864152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2166  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1464  hypothetical protein  34.12 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00913316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2360  protein of unknown function DUF339  27.14 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>